mega进化是神奇宝贝提升实力的一个重要途径，只要能进行mega进化，普通神奇宝贝就会获得不逊色于二级神兽、幻兽或者准神的实力，如果是准神或者是幻兽进行mega进化，实力则会强于一级神兽，若是一级神兽mega进化，那更不得了，连创世神阿尔宙斯都被比下去。
在小智收服的80只神奇宝贝中，也存在不少能够mega进化的类型，不过编剧实在是偏心，在卡洛斯旅行的时候小智没有获得过一块mega石，就给了个说是千年难得一遇的甲贺忍蛙，进行羁绊进化来代替mega，然而即使是羁绊进化后的甲贺忍蛙也只是和普通的mega进化神奇宝贝一样，条件还更加苛刻一些（需要打败一只对方的神奇宝贝才能羁绊进化），当然，小智手中能进行mega进化的神奇宝贝不止这么点，只要获得了mega石，这些神奇宝贝就能mega进化，可惜的是有部分已经被小智放生了。
1.大比鸟（比雕）
大比鸟能进行mega进化，进化后的mega大比鸟有着必中的特性无防守，无论什么技能都会命中。mega大比鸟本身更偏向于特攻，必定命中关都暴风还是非常可怕的。当然，小智的那只大比鸟早就被放生了。
2.喷火龙
喷火龙无疑是小智的王牌，小智正是用喷火龙击败了急冻鸟。喷火龙有两种mega进化，变为龙神奇宝贝的超级喷火龙X，以及属性不变，自带晴天的超级喷火龙Y。
3.赫拉克罗斯
赫拉克罗斯也是小智的王牌之一，进行mega进化后的赫拉克罗斯攻击力仅次于超级超梦X（当然要排除特性和专属道具）
4.蜥蜴王
蜥蜴王同样是小智的王牌，在神奥联盟上正是依靠蜥蜴王补刀才击败了达克多的那只幻兽达克莱伊。mega进化后的蜥蜴王变为龙神奇宝贝，并且有着超快的速度，可惜特性有些鸡肋。
5.大针蜂
没想到吧！小智其实有一只大针蜂，这只大针蜂是小智在捕虫大会上收服的，不过随后小智就将这只大针蜂送给了奈奈。因为本身是虫属性的关系，mega大针蜂种族值不算高，不过全部都加到点上了，舍弃了所有的防御，只剩下攻击以及速度的mega大针蜂是所有人的恶魔。
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