对于藏传佛教，很多人都认为达赖级别高，班禅级别低，这种理解是错误的，其实他们两个是没有隶属关系的。
达赖和班禅是是藏传佛教格鲁派（黄教）的两大活佛系统。西藏佛教界认为，达赖是“欣然僧佛”即观世音菩萨的化身；班禅是“月巴墨佛”即无量光佛的化身。清朝中央政权把达赖和班禅置于同等地位，分别由皇帝直接领导，他们都受清朝政府的册封。因此，达赖和班禅之间，互无隶属关系。
达赖和班禅的统治地区也不一样。达赖统治的地区是卫藏的前藏，就是拉萨、山南地区。所以达赖的冬宫在拉萨，就是布达拉宫。班禅统治的地区呢，是卫藏的后藏，就是日喀则地区。所以历代班禅的主寺就在日喀则扎什伦布寺。
一世班禅克珠杰与一世达赖根敦珠巴同为藏传佛教黄派创始人宗喀巴的弟子，而克珠杰当时的地位要高的多，与师父宗喀巴、师兄甲曹杰被后世并称为“师徒三尊”，也就是黄教创始期三个最重要的领袖。克珠杰在师父、师兄去世后做了黄教第三任首脑，还指导过年轻师弟根敦珠巴的学业，因此如果认为从那时起班禅就担任了达赖的老师，似乎也说得过去。
清廷认为二者都是喇嘛教最高等级的僧侣，对待二者的礼仪一模一样。康熙五十二年（公元1713年），康熙帝册封五世班禅，在诏书中有这样的话：“班禅呼图克图，为人安静，熟悉谙经典，勤修贡职，初终不倦，甚属可嘉。着照封达赖喇嘛之例，给以印册，封为班禅额尔德尼”。
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