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Cell丨解析RAS(ON)分子胶抑制剂daraxonrasib的获得性耐药机制

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RAS突变是胰腺癌、结直肠癌和肺癌等恶性肿瘤的主要驱动因素之一,由于缺乏药物结合口袋,RAS长期被认为是“不可成药”靶点。KRAS G12C抑制剂的成功证明了RAS可被直接靶向,但这类药物主要作用于GDP结合的非活性态RAS,即RAS (OFF) 状态,且覆盖的突变类型有限。RAS(ON)分子胶抑制剂的出现打破了这个僵局:其通过招募Cyclophilin A(CYPA)到活性态RAS表面,形成RAS-分子胶-CYPA三元复合物,从而阻断RAF、PI3K等效应蛋白的结合并抑制肿瘤生长。代表性药物daraxonrasib(RMC-6236)已在临床中展现出良好的抗肿瘤活性,并已获得美国FDA突破性疗法认定。然而,随着临床试验推进,获得性耐药成为制约该类药物长期疗效的瓶颈。由于RAS(ON)分子胶的作用机理不同于传统抑制剂,其耐药机制尚不清楚,亟需系统解析以指导临床二线治疗方案的制定和新一代药物的设计。

近日,Memorial Sloan Kettering Cancer Center的PiroLito团队,在Cell期刊发表题为Disrupted molecular glue complex drives RAS inhibitor resistance的研究,系统解析了RAS(ON)分子胶抑制剂daraxonrasib的获得性耐药机制。研究分析了40例患者的治疗前及耐药后配对临床样本,并结合CRISPR碱基编辑筛选、结构生物学、细胞功能实验以及动物模型,发现多种耐药突变虽发生于不同分子节点,但最终均收敛于一个共同机制:破坏RAS-分子胶-CYPA三元复合物的形成,从而恢复RAS信号传导。


研究首先发现,约45%的患者在治疗进展时出现RAS通路相关的获得性改变,包括KRAS Y64突变、BRAF激酶失活或低活性突变、KRAS扩增,以及MAPK或PI3K/MTOR通路改变等。机制研究显示,KRAS Y64突变通过破坏Y64残基与daraxonrasib芳香环之间的π-π堆积作用,削弱药物与RAS的结合,从而降低三元复合物的稳定性。除KRAS Y64外,研究还在临床前模型中发现了KRAS Y71H突变。与Y64不同,KRAS Y71H并不位于药物结合界面,而是通过增强RAS与RAF RBD结构域之间的相互作用,竞争性减少药物的结合。结构解析进一步发现,KRAS Y71H可与CRAF RBD中的R67残基形成新的相互作用,从而提高RAS-RAF亲和力。

此外,研究团队在耐药患者的样本中发现了多种激酶失活或低活性的Class III BRAF突变。这类BRAF突变依赖RAS诱导的RAF二聚化来激活ERK信号,而daraxonrasib作为pan-RAS(ON)分子胶,本应阻断RAS介导的RAF激活。进一步研究发现,Class III BRAF突变通过增强RAF二聚化,使RAF半胱氨酸富集结构域(CRD)重排以更稳定的构象结合RAS,从而阻碍daraxonrasib招募CYPA至RAS,削弱三元复合物的形成并恢复下游 ERK 信号。

在机制解析的基础上,研究进一步探索了克服耐药的干预策略。针对KRAS Y64突变,研究团队鉴定出一种新型RAS(ON)分子胶抑制剂RMC-4791。结构和功能实验表明,RMC-4791以不同于daraxonrasib的方式结合RAS,对Y64依赖性降低,因此能够在KRAS Y64突变背景下有效抑制RAS信号。针对BRAF二聚化驱动的耐药,研究发现联合使用RAF二聚体抑制剂PLX8394,或MEK/ERK抑制剂,可恢复daraxonrasib对肿瘤细胞增殖的抑制作用。在小鼠异种移植模型中,RAS抑制剂与PLX8394联合治疗能够有效抑制由BRAF突变驱动的耐药肿瘤生长,提示该策略具有进一步临床转化的潜力。

总体而言,该研究系统阐明了RAS(ON)分子胶抑制剂获得性耐药的分子机制。研究表明,肿瘤可通过削弱分子胶与RAS的结合、增强RAS-RAF相互作用或促进RAF二聚化等不同方式,破坏分子胶复合物的形成。更重要的是,这些发现不仅为理解daraxonrasib及同类RAS分子胶药物的耐药演化提供了理论支撑,也为开发新一代RAS(ON)抑制剂和设计联合治疗方案提供了重要依据。


纪念斯隆凯特琳癌症中心的桑奔、Ling Feng Ye、付正和Yasin Pourfarjam 为本研究的共同第一作者,Piro Lito 教授为通讯作者。Antonio Cuevas-Navarro、范仕杰和胡凤为本研究做出了重要贡献。研究得到了来自Revolution Medicines、Weill Cornell Medical College、Dana-Farber Cancer Institute、NYU Langone Health、 Virginia Cancer Specialists 、Huntsman Cancer Institute及MD Anderson Cancer Center等机构的支持。

原文链接:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(26)00332-6

制版人: 十一

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