生命科学大数据操作系统助力研究降本增效？CCF开源创新大赛暨第二届Bio-OS开源开放大赛报名开启

随着人工智能技术的进步和快速发展，近年来，谷歌 DeepMind、微软、IBM、英伟达等国际知名公司纷纷布局科学智能（AI for Science）。

这种被称为科学研究和发现的“第五范式”，对自然界和人类社会中的现象以及规律，进行数据分析和处理、预测、模拟、优化，为现阶段人们遇到的各类科研难题带来了全新的设计模式和解决方案。

以生物信息学研究为例，长期以来，该领域的学者们面临着海量生物学数据和信息的挑战。

利用先进科研工具有望为实现重要的科学突破和发现插上“翅膀”，用更智能的方式，加速推动领域的发展。

不仅让人们对生命科学的理解更加深刻，还可以为领域的关键技术难题提供新的解决思路。

Bio-OS：生物医学数据分析的技术支撑底座

广州实验室与火山引擎合作，开发了开源开放的生物医学大数据操作系统（ Bio-OS，Bio-medical big data operating system）。

来自医疗机构、科研院校、实验室以及企业的研究人员，通过 Bio-OS 能够为生信研究降本增效，持续收集生命科学研究的多种数据集和工具资源，降低包括处理海量数据在内的计算门槛。

在生信基因分析方面，Bio-OS 能够快速、灵活、便捷地开启生信分析工作和研究。

在实时交互分析方面，Bio-OS 将 jupyter hub 等组件集成，提供符合生信领域研究人员使用习惯的自定义实时交互分析环境。

在生信数据管理方面，Bio-OS 让生信数据模型管理成为可能。

并且，研究人员通过这种新型的科研工具，可加速完成大数据的挖掘分析任务，为生命健康科研创新提供了一种兼具通用性和基础性的、生物医学数据分析的技术支撑底座。

为推动 Bio-OS 更好地发展和在更广泛场景中的落地，Bio-OS 已经开源，并需要更多来自社会的力量共同参与它的升级迭代。

共同探索生物信息学发展的新趋势与新方向

2024 年 5 月 20 日，中国计算机学会（CCF，China Computer Federation） 开源创新大赛暨第二届 Bio-OS 开源开放大赛正式启动。

本次大赛以“开源共赢，科学无限”为宗旨，面向全国生物信息领域的高校师生、科研工作者、以及相关企业和组织等邀请参赛，希望通过大赛牵引和开源开放的 Bio-OS 平台支撑，推动国内生物信息领域的交流与合作，共建一个“开放、创新、合作、共赢”的新生态。

本次组队 1-3 人/组，大赛主要面向对象包括：全国生物信息领域的高校师生、相关企业组织、以及科研机构等。

在赛制安排方面，共经历四个阶段，包括：报名、初赛、初赛评审、线下总决赛。其中，9 月 13 日初赛截止提交作品，计划在 11 月进行线下总决赛。

图丨CCF 开源创新大赛暨第二届 Bio-OS 开源开放大赛赛制安排（来源：DeepTech）

本次大赛分为三个赛道、分别为：论文复现赛、任务挑战赛、 AI 算法赛道。三个赛道奖金总额为 31.5 万，其中，每个细分赛道将评出一等奖 1 名，每名奖金 5 万元；二等奖 2 名，每名奖金 2 万元；三等奖 3 名，每名奖金 5000 元。此外，大赛还将评选出若干名优胜奖。

图丨CCF 开源创新大赛暨第二届 Bio-OS 开源开放大赛奖金设置（来源：DeepTech）

大赛主席

李亦学

广州实验室研究员，博士生导师，科学数据平台主任，预防预警部负责人，中国科学院特聘研究员，上海科技大学特聘教授，上海交通大学生命科学与技术学院教授，中国生物信息学会（筹）副理事长，上海生物信息学会理事长，国家蛋白质机器重点专项总体专家组专家，国家生物安全重点专项总体专家组专家，国家精准医疗重点专项总体专家组专家

评委专家（评委按照姓氏首字母排序）

蔡宏民

华南理工大学计算机科学与工程学院教授，博士生导师，国家杰青，中国计算机学会生物信息学专业委员会常务委员，中国自动化学会智能健康与生物信息专业委员会常务委员

王秀杰

中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员，博士生导师，国家杰青，分子系统生物学研究中心主任，国家重点研发计划项目首席科学家

叶凯

西安交通大学教授，信息与生物医学交叉研究中心负责人，博士生导师，国家杰青，创新港 MED-X 研究院数字医学研究所所长，电子信息科学研究院生物信息学研究所所长，西安交大第一附属医院单细胞测序平台主任，陕西省生物信息学学会理事长

杨威

英特尔中国人工智能架构师，负责客户在人工智能相关领域的性能调优和管线开发整合。目前主要参与项目领域包括：LLM 文本生成，多模态文档 RAG，智能智造与缺陷检测，数据智能与推荐系统，AI 小分子药物虚拟筛选，蛋白结构预测与从头设计。代表工作：AlphaFold2 在英特尔 CPU 上的推理加速，可定制的 GAP 知识库文档大模型问答

杨跃东

中山大学计算机学院教授、博士生导师，国家超算广州中心总工程师，智能健康医疗中心副主任

赵方庆

中国科学院北京生命科学研究院研究员，博士生导师，国家杰青，科研部副主任、技术平台部主任、计算基因组学研究组组长，中国生物信息学会基因组信息学专委会主任

赵兴明

复旦大学类脑智能科学与技术研究院教授，国家杰青，复旦大学智能复杂体系基础理论与关键技术实验室双聘教授，计算神经科学与类脑智能教育部重点实验室副主任

章文嵩

CCF 会士、常务理事、CCF 开源发展委员会副主任。开源项目 LVS 创始人，目前主要做云原生相关的创业孵化。曾任高瓴投资运营合伙人，滴滴出行高级副总裁，阿里副总裁和阿里云 CTO，TelTel 联合创始人，国防科技大学计算机学院副教授

张鑫

北京火山引擎科技有限公司副总裁、字节跳动开源委员会治理运营负责人

本次大赛是在中国计算机学会和广州实验室指导下，由火山引擎和 Intel 联合主办的一项生物信息领域的全国性公益大赛，协办单位包括中国生物信息学学会（筹）、中国计算机学会开源发展委员会、上海生物信息学会、广东省生物信息学会，公益支持单位为中国光华科技基金，合作单位包括南方医科大学、成都东软学院、寻因生物、DeepTech、51CTO 等。

目前，CCF 开源创新大赛暨第二届 Bio-OS 开源开放大赛已开始启动报名通道，现邀请广大高校学生、生信领域爱好者共同探索生物信息学发展的新趋势与新方向，参与实训，挑战自己。参赛报名请扫码下图二维码，或点击文章底部“阅读原文”。

关于火山引擎：

火山引擎（https://www.volcengine.com/）是字节跳动旗下的云服务平台，将字节跳动快速发展过程中积累的增长方法、技术能力和应用工具开放给外部企业，帮助企业构建体验创新、数据驱动和敏捷迭代等数字化能力，实现业务可持续增长。