上海
撰文丨王聪
编辑丨王多鱼
排版丨水成文
以连接组和空间转录组为代表的多组学研究已进入单细胞分辨率时代，这需要具备单细胞水平空间定位能力的参考脑图谱。然而，现有的脑图谱都没能做到单细胞可见的空间定位。
2025 年 7 月 2 日，海南大学/华中科技大学骆清铭院士、龚辉教授及加州大学洛杉矶分校董红卫教授团队（丰钊为第一作者）合作，在国际顶尖学术期刊Nature上发表了题为：A mouse brain stereotaxic topographic atlas with isotropic 1 μm resolution 的研究论文。
该研究以 1 微米的各向同性分辨率绘制了小鼠三维脑区和立体定位图谱，该图谱可为大型脑图谱项目提供数据分析和可视化支持，有望成为一种多功能脑科学工具，用于在单细胞水平上研究整个大脑。
在这项最新研究中，研究团队通过连续微光学切片断层成像技术，以各向同性 1 微米的分辨率呈现了一套基于尼氏染色的小鼠全脑细胞结构数据集。
通过整合多模态图像，研究团队构建了小鼠大脑三维参考图谱——STAM，提供了 916 个结构的三维形貌，并能够生成任意角度的 1 微米分辨率切片图像。研究团队进一步开发了一个基于信息学的平台，用于可视化和共享图谱图像，提供诸如脑切片配准、神经元回路绘制和智能立体定向手术规划等服务。该图谱可与广泛使用的立体定位图谱兼容，支持在二维空间中对相应冠状面进行跨图谱导航，并在三维空间中实现图谱空间的跨图谱空间映射。
通过为大型脑图谱项目提供数据分析和可视化支持，该研究开发的 STAM图谱有望成为一种多功能的脑科学工具，用于在单细胞水平上研究整个大脑。
论文链接：
https://www.nature.com/articles/s41586-025-09211-8
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