2019-2020年河北省百日咳鲍特菌分离株基因多样性分析

本研究揭示了河北省百日咳鲍特菌（Bordetella pertussis, Bp）分离株的基因多样性，并发现与疫苗株相比，主要毒力蛋白基因和核心基因组发生了明显变化，可能导致Bp流行株发生疫苗免疫逃逸。研究建议加强Bp基因组监测，以有效防控百日咳流行并完善百日咳疫苗免疫策略。

结果摘要：

1. 62株Bp分离株的多位点序列分型（MLST）均为ST-2型，与疫苗株的ST-1型不同。

2. 56株携带ptxP1基因的分离株发生了23S rRNA A2047G突变，而6株携带ptxP3基因的Bp菌株未发生该突变。

3. MAST分析显示6种型别，主要为prn1/ptxP1/ptxA1/fim3-1/fim2-1型。

4. MGT分析在不同水平上分别包括1种、2种、3种、14种和52种型别。

5. BPagST包括BPagST-37型（56株）和BPagST-4型（6株）。

数据摘要：

MLST结果显示所有62株Bp分离株均为ST-2型，与疫苗株的ST-1型不同，表明流行株与疫苗株在基因型上存在差异。

23S rRNA基因突变分析显示，56株携带ptxP1基因的分离株发生了A2047G突变，而6株携带ptxP3基因的Bp菌株未发生该突变，这可能与大环内酯类耐药性有关。

MAST分析中，47株主要为prn1/ptxP1/ptxA1/fim3-1/fim2-1型，而6株为prn缺陷型，这表明prn基因的多态性和prn缺陷型分离株的传播可能代表细菌对疫苗诱导的免疫力的选择性回避。

MGT分析在MGT1至MGT5水平上分别包括1种、2种、3种、14种和52种型别，显示了Bp分离株的基因组多样性。

BPagST分析中，56株为BPagST-37型，6株为BPagST-4型，与疫苗参考株的BPagST-3型不同。

数据总结：

数据表明河北省Bp流行株在基因型上与疫苗株存在显著差异，特别是在MLST、23S rRNA基因突变、MAST和BPagST方面。这些差异可能导致Bp流行株发生疫苗免疫逃逸，从而影响疫苗的保护效果。此外，prn基因的多态性和prn缺陷型分离株的出现可能代表了细菌对疫苗诱导的免疫力的选择性回避，这需要在疫苗研发和疾病防控中予以重视。

综合结论：

河北省Bp流行株的基因多样性分析显示与疫苗株存在显著差异，这可能影响疫苗的保护效果并导致疫苗免疫逃逸。因此，建议加强Bp基因组监测，并考虑这些基因型变异在疫苗研发和疾病防控策略中的潜在影响。同时，建议进行更大规模的多中心研究以进一步验证这些发现，并探索新的疫苗策略以应对Bp的进化。

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