朱元璋在打天下的时候，其势力范围在南方，当时朱元璋听从了手下建议，渡江攻克了金陵，改名应天府，也就是今天的南京城。
等到大明建立后，朱元璋在南京称帝，把首都定在了这里。
其实朱元璋本身是不满意的，一直有迁都的打算。他理想的是首都是开封，他还亲自前去开封考察。但是李善长等人不同意，认为开封无险可守，所以朱元璋放弃了开封。
他也曾经想在家乡凤阳建都，毕竟这是光宗耀祖的事，多露脸。最终也由于反对而放弃。
不过他又开始考虑西安和洛阳，甚至也派太子朱标前去考察，不过朱标身体不好，在这个过程中去世了。
这下让朱元璋把迁都的事搁置了，因为他还有更重要的事情要做，那就是选定接班人，并好好的培养他。
不过朱允炆继位初，燕王朱棣发动了靖难之役，把自己的侄子赶了下去，自己做了皇帝。朱棣也不喜欢南京，希望把首都迁到北京。
毕竟北京是他的根据地，他的根基在这里，在南京人生地不熟，反对势力仍然存在，危险也很大。
同时，北京处于防御蒙古的前沿阵地，这样可以对蒙古形成巨大的威胁，这也就是天子守国门。
当然了，到了明朝时期，其实北京的发展已经很发达了，尤其是经过元朝近百年的经营。
朱棣迁都北京后，南京设为留都，被保留下来。
其实两京制度在历史上并不稀奇，这也不是朱棣独创的。但是与前朝所不同的是南京当时拥有和北京中央机构类似的体系，不过由于皇帝在北京，所以给人的感觉南京就是养老的地方。
之所以这样，一方面是想保留南京作为经济中心的地位，毕竟当时的南方是经济重心，再重视北方，也不可能把南方忘掉。
另一方面其实是避免山高皇帝远，有人在背后使绊子。但是朱棣绝对想不到两百年后的大明还会有机会用到南京。
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