日本明仁天皇于2017年9月20日下午，以“私人旅行”的名义参观了位于埼玉县日高市的高丽神社，高丽神社是日本为纪念1300多年前因亡国东渡日本的高丽王子若光而修建的神社。这是历史上日本天皇首次参观纪念朝鲜“渡来人”的神社。
加之2001年12月18日，明仁天皇在68岁生日前的记者会上，曾就关于日本皇室和朝鲜半岛之间的关系表示：“《续日本纪》中记载，（平安时代）恒武天皇的生母是百济武宁王的后代，作为恒武天皇的后代，我感受到自身与韩国之间存在的渊源”，明仁天皇的这番话无疑承认了日本皇室中具有朝鲜半岛渡来人的血统，在当时引发了各界对日本皇室血统的好奇心。
关于日本皇室血统问题的争论一直以来是日本历史学研究的一段公案，至今无解。日本学者当中也没有一致的结论。中国起源说、朝鲜起源说、甚至亚洲某游牧民族起源说，各种说法都有。由于日本皇室被神化为万世一系，再加上有关皇室的史料记载充满虚构和断层，导致天皇家族的“身世血统”始终是一个谜团。
（古人绘制的日本第一代天皇陵园外景图。藏于日本奈良县立图书馆）
中国起源说：曾有一段时间，在中国史学界流传甚广的观点是，神武天皇（日本初代天皇）就是当年秦始皇派遣出海求仙药的徐福。日本国内也有一些人支持这样的观点，日本前首相羽田孜称自己为徐福后裔。不仅日本许多地方保留着类似徐福登陆纪念碑、徐福墓在内的遗址，而且很多地区的民众将其作为神进行供奉。
但这一说法近来遭到学术界的质疑和否定，徐福这一人物及其事件本身就存在很大的争议，缺乏可靠的历史文献来证明。虽然秦、汉动乱之际，有大批沿海中国人避居日本，但日本天皇的祖先是中国人的论断几乎是不可能的。
朝鲜半岛起源说：相较中国血统说，朝鲜血统说更具有遗传学上的“论据”。东京大学医学院曾就东亚各国第六号染色体的遗传基因进行测试对比，发现现代日本人与冲绳人、大陆人或阿伊努人都不像，反而更接近朝鲜人。说明朝鲜半岛“渡来人”对现代日本人的形成产生了重大的影响。
尽管日本皇室的起源问题难以下定论，但史料中关于日本皇族拥有朝鲜半岛血统的记载却是不争的事实，再加上天皇自身的认可，可见日本皇室确实流淌着百济王族的血。
亚洲游牧民族起源说：也有部分学者根据考过证据认为，古日本是由众多本地的部落以及从东北亚地区迁移而来的游牧民族在相互融合演变过程中形成的。由于大陆而来的游牧民族生产力、生产工具较为发达，最终统一各部落，进而形成第一代天皇。并且据墓葬品的不同及相关史料的记载，认为5世纪后的天皇家族与此前的王族并非同一家族，打破天皇万世一系的说法。
日本皇室拥有朝鲜人血统确是事实，但关于天皇家族起源的问题，根本上还是需要开放早期天皇的陵墓，以便学者对此进行考古学的研究和考证。
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