英文名称:AF488-NH2,AF488 amine,AF488-amine,AF488 amine NH2,Alexa Fluor488 NH2,Alexa Fluor488 amine
中文名称:AF488氨基
分子式:C31H32N4O13S2
分子量:732.74
激发波长:495 nm
发射波长:519 nm
消光系数:71800
性状:深橙色固体固体
结构式:
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一、基本化学定义与形式区分
AF488-NH₂:指染料分子本身末端带有游离氨基(-NH₂)的化学形式。该氨基可作为后续化学修饰的官能团,通过羧酸活化等步骤,将AF488染料模块共价连接到其他分子上。
AF488-氨基反应性衍生物:通常指AF488染料已预先与活性酯(如N-羟基琥珀酰亚胺酯,NHS ester)等连接子耦联的试剂形式。该形式可直接与靶分子上的伯氨基(-NH₂)在温和条件下发生高效、专一的酰胺化反应,实现共价标记。
二、 主要物理化学与光学特性
吸收与发射光谱:AF488的最大吸收峰位于约495 nm波长处,最大发射峰位于约519 nm波长处。此光谱特性与FITC(异硫氰酸荧光素)类似,可使用配备标准FITC滤光片组的荧光成像系统或流式细胞仪进行检测。
荧光亮度与稳定性:相较于传统荧光素类染料,AF488具有更高的摩尔吸光系数与荧光量子产率,因此能提供更强的荧光信号。其结构中的磺酸基团增强了染料的水溶性,并降低了其对pH环境变化的敏感性,使荧光信号在生理pH范围内更为稳定。
光稳定性:AF488具有较好的抗光漂白能力,适用于需要长时间观察或多次扫描的实验。
三、主要应用方向
生物大分子标记:AF488的氨基反应性衍生物(如NHS酯)是标记蛋白质、抗体、肽段、寡核苷酸等生物分子伯氨基的常用工具。标记后的偶联物可用于追踪目标分子在复杂体系中的位置、分布、丰度及相互作用。
细胞与组织成像:经标记的抗体或特异性配体可用于荧光显微技术,对固定的或透化的细胞、组织切片中的特定靶标进行可视化定位与分析。
流式细胞分析:标记有AF488的抗体广泛用于流式细胞术,通过对细胞表面或内部特定抗原的荧光检测,实现细胞群体的鉴定、分型与功能分析。
生物传感与检测:AF488可作为能量供体或受体,应用于荧光共振能量转移(FRET)体系中,构建用于研究分子构象变化或相互作用的生物传感器。
四、使用、储存与处理注意事项
反应条件:氨基反应性衍生物(如NHS酯)与靶分子的标记反应通常在pH 7.0-9.0的缓冲溶液中进行。应避免含有游离氨基的缓冲成分(如Tris、甘氨酸)的干扰。
储存稳定性:固体粉末形式的试剂应在-20°C或更低温下干燥避光保存。溶解后的溶液应尽可能现配现用,避免反复冻融与水分的引入导致活性酯水解失活。
光敏感性:该化合物对光敏感,所有操作步骤建议在避光或弱光条件下进行。
化学兼容性:标记反应及后续纯化过程需注意避免强还原剂、强亲核试剂或剧烈条件,以防染料降解或连接键断裂。
五、质量控制与验证
为确保实验结果的可重复性,对AF488标记的偶联物进行质量评估是必要的步骤。常见的评估指标包括:
染料-蛋白质摩尔比(D/P值):通过测量染料在495 nm处的吸光度与蛋白质在280 nm处的吸光度(经染料贡献校正后)进行计算。适宜的D/P值有助于平衡荧光信号强度与标记对生物分子功能的影响。
标记效率与游离染料去除:通常采用凝胶过滤色谱或透析等方法去除未反应的游离染料,并通过相关色谱或电泳技术验证纯化效果。
生物活性保留验证:对于抗体等功能性生物分子,标记后需通过特异性实验验证其结合活性是否得到保持。
以上由WWH编辑提供的试剂信息仅供参考,不作为具体的实验方案、操作步骤或使用承诺。
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