抗战胜利，他带杂牌军进南京劫收；孟良崮战役又见死不救，遭清算

1945年8月15日，中国军民经过14年艰苦鏖战，终于迎来了抗日战争的最后胜利。举国欢腾之际，避居重庆多年的蒋介石政权开始积极筹划还都事宜，并对收复首都南京进行了一番周密的计划：比如由哪支部队进驻，该怎么进去，进去后要有什么表现，承担什么职责等等。

桂军杂牌抢先进入首都受降

但这边还没有计划好，那边就传来消息，桂系第7军第171师在该军副军长李本一率领下，已经开进南京受降去了。李本人还打出了受降大员的招牌，不仅给伪政府要员封官许愿，还接收了大量的房子、车子、票子和金条。第171师的桂军官兵也有样学样，在南京城内大发横财。

后来，在蒋介石的严令和军政部再三督促下，第171师撤离南京，前往其指定受降地蚌埠驻扎。南京城改由蒋介石的嫡系精锐新6军和第74军接收，但此时风头已经被桂系抢光，令蒋介石一系恼怒异常。但第7军是桂系的起家老本，无论北伐还是抗战期间都战功赫赫，因此根本奈何不得。

事后追责发现都动不起

1946年春全国军队整编时，黄河以南国民党军所属原本两师六团制的军都被改编为两旅四团制的整编师，惟独第7军搞特殊，在桂系二号人物、时任国防部长的白崇禧庇护下，该军非但获得暂缓整编待遇，还因“战略机动需要”获得大量补充，全军保持2.3万余人精锐，还配备54门各式大口径火炮。

动不了第7军，蒋介石只好把火都撒在“罪魁祸首”李本一身上，非但多次否决桂系将其升任军长的申请，还借擅入南京一事让他官司缠身。不过，李本一毕竟是桂系虎将，又对桂系立过大功，在惨烈的淞沪会战中，桂系第7军等部奉命掩护上海50余万守军撤退，而李本一团则担任第7军后卫，直到最后一刻才得到撤退命令，率300残军游过富春江撤回。因此，李本一长期在桂系内部受重用，虽挂名副军长，却实际负责全军指挥。

孟良崮战役再次抗命导致友军覆灭

1947年5月孟良崮战役中，李本一再度惹怒蒋介石，被抓住了把柄。当时，蒋介石麾下头号美械精锐、“五大主力”之首、“御林军”整编74师被围孟良崮，遭到华东野战军5个纵队围攻，形势危急。蒋严令周围部队火速救援，第7军当时就在整编74师右翼，其主力第171师所在的河阳镇距离孟良崮主峰也才不到80里，轻装疾行，1天就能赶到。

但第7军从5月15日上午8时接到正式命令开始，整整1天，仅派了第172师1个团前去解围。直到当天晚上，陆军总长顾祝同发现了这一“消极怠工”行为，向桂军在山东战场的总指挥张淦施压，李本一等人才重视起来，但也仅派第172师出战，直到16日孟良崮战役结束，该师也未能靠近战场。

判刑3年仅3个月就官复原职

战后，整编74师3.2万人全军覆灭，师长张灵甫阵亡，重点进攻山东计划也因此受挫。蒋介石震怒之下，严令彻查责任。当时同样位于孟良崮右翼的整编83师师长李天霞，系黄埔三期毕业的嫡系中央军将领，也被撤职查办、送军事法庭审判。李本一这样有前科的杂牌将领，自然劫数难逃。

1947年7月25日，军事法庭判处李本一3年有期徒刑。不过，在白崇禧的庇护下，一切的一切都只是做做样子，李在监狱里“坐”了三个月，就重回第7军当副军长了。