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Cell:华人团队发现真核生物的新型DNA甲基化修饰,并揭示其对精子功能至关重要

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撰文丨王聪

编辑丨王多鱼

排版丨水成文

在原核生物中,DNA 以三种形式发生甲基化修饰:N6-甲基腺嘌呤(6mA)、N4-甲基胞嘧啶(4mC)以及5-甲基胞嘧啶(5mC)。这些 DNA 甲基化修饰虽然比例相对较低,但发挥着一系列关键作用,包括宿主基因组防御和转录调控。

在真核生物中,目前仅发现 5mC 在基因组上广泛分布,6mA 在单细胞生物中有零星分布,而 4mC 是否存在仍是个谜。

2025 年 4 月 9 日,奥地利科学技术研究所冯小琦团队(James Walker张静懿刘亚林许淑娟为论文共同第一作者)在国际顶尖学术期刊Cell上发表了题为:Extensive N4 Cytosine Methylation is Essential for

Marchantia
Sperm Function 的研究论文。

该研究首次证明了 4mC 在真核生物中的存在,并阐明了在精子成熟阶段基因组中发生了广泛的 4mC 修饰,这对于精子的发育与功能至关重要。

在这项最新研究中,研究团队发现,真核生物地钱

Marchantia polymorpha
) 的精子发生过程涉及两波大规模的 DNA 甲基化重编程。第一波 ,5mC 从转座 子扩展至整个基因组;第二波 , 4mC 特异性发生在 基因区域(genic region),覆盖超过 50% 的 CG 位点。

4mC 需要一种甲基转移酶(MpDN4MT1a),该酶在精子发生后期特异性表达。敲除 Mp

DN4MT1a
基因会改变精子的转录组,导致精子游动和生育缺陷,并损害受精后的发育。

这些研究结果揭示了真核生物中广泛存在 4mC 修饰,鉴定出一个真核生物甲基转移酶家族,并阐明了 4mC 在生殖发育中的生物学功能,从而扩展了真核生物 DNA 功能性修饰的范围。

该研究的核心发现:

  • 在地钱精子发生过程中会发生广泛的 5mC 重编程;

  • 在地钱的精子中,4mC 在 CG 位点上广泛存在;

  • 4mC 需要一种在精子发生晚期特异性表达的甲基转移酶;

  • 4mC 调控精子的 mRNA 含量、活力和生育能力。

总的来说,该研究首次证实了 4mC 在真核生物中的存在,揭示了在地钱精子成熟过程中基因组范围内编码区的大规模 4mC 修饰,保障了精子的正常发育和正常功能,对精子命运的重要决定性,发现并鉴定了负责 4mC 修饰的真核 4mC 甲基转移酶——MpDN4MT1a

该研究拓展了我们对于真核生物表观遗传学的认知,发现了参与生殖发育过程至关重要的表观遗传学新修饰,开创了 4mC 在真核生物中功能的研究新方向,拓展了表观遗传学领域的边界。

论文链接

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(25)00287-9

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