矮黑人也称尼格利陀人（Negrito），他们被认为是东南亚地区最早的原住民，其体貌特征正如其名，皮肤深色且身材矮小。关于这一人群的研究已经有很多年了，但是目前人们对其的了解仍比较少。这是由于矮黑人的特征受环境影响很大，其骨骼在不同环境，不同饮食结构的社会中会出现变异的类型，常常给判断带来困难，这也是为什么研究进展相对缓慢的原因。
夏威夷大学的Lawrence A. Reid在这一领域的研究比较值得一提：以东南亚岛屿国家菲律宾为例。目前的菲律宾有两个差异明显的种族。一个是以菲律宾几个大岛：吕宋岛、内格罗斯岛、班乃岛等岛屿的矮黑人（Negrito）族群，在遗传和物理特性上，与新几内亚和美拉尼西亚居民周围地区，澳大利亚的土著群体，和其他小黑人群体的马来半岛、安达曼群岛相似，称为Australoid（澳大利亚土著）。
另一个以菲律宾的非矮黑人人口为代表，在遗传和物理特性上，与中国、日本及其周边区域相似，称之为Mongoloid（蒙古人种）。这一人群和在上个回答提到的南岛语族密切相关。南岛语族到来之前（不早于距今6000年），菲律宾仅有澳大利亚土著存在，而之后则是两种人群的融合。
时至今日，南岛语已经是菲律宾矮黑人和非矮黑人的共同语言，但是在此前的新石器时代，矮黑人使用的是另一种不同于其它族群的语言，而菲律宾外部的矮黑人族群所使用的语言和菲外部的澳大利亚土著族群也有不同。关于矮黑人，无论是语言，基因还是族群的诸多特征，仍有很多问题有待进一步的研究发现。
参考文献：
Jay T. Stock,The Skeletal Phenotype of "Negritos" from the Andaman Islands and Philippines Relative to Global Variation among Hunter-Gatherers
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