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马来西亚作为 ATA 单证册公约成员国，支持商业样品、专业设备、展会展品等类型货物凭 ATA 单证册通关，且有单证填写语言、续签、管制货物核查等特殊要求，以下是针对马来西亚的 ATA 单证册申请、通关及核销全流程说明：
国内申请 ATA 单证册
备齐材料：申请人（境内注册企业、自然人等）准备 ATA 单证册申请表、货物清单（需注明马来西亚展会或商业对接相关用途，明确品名、规格、数量等）、身份证明文件（企业带营业执照，个人带身份证）。若委托代办，还需准备英文授权委托书。

提交审核缴费：通过中国贸促会 ATA 业务申办系统在线提交材料，预审通过后缴纳出证手续费、保险费并提交反担保。预审通常 2 个工作日，审核通过后 3 个工作日左右可领取单证册。需特别注意，单证册需用英语或马来语填写，若用其他语言需准备对应翻译件，避免马来西亚海关审核受阻。
中国出境通关（以上海口岸为例）
持 ATA 单证册及货物到口岸海关申报，使用单证册中的黄色出口凭证填报信息，海关核对货物与单证一致后，会在绿色封面及黄色出口凭证、存根上签注盖章，留存凭证后放行，完成出境流程。
马来西亚入境通关
前期核查：入境前建议通过马来西亚海关官网，核实货物是否为武器、雷达等受管制物品，若为管制类，需提前办理对应许可文件，ATA 单证册不能替代许可证。
现场申报：在马来西亚的港口、机场等有权办理 ATA 单证册的海关口岸，凭白色进口凭证申报。海关会核对单证与货物信息，确认无误后签注盖章，并标注样品复出口的期限，该期限不得超过 ATA 单证册 1 年的最长有效期。
特殊时段注意：马来西亚主要港口和机场支持 365 天 24 小时办理 ATA 单证册通关，但非常规时段通关需提前确认海关配套服务是否到位，避免耽误流程。
马来西亚复出口与国内复进口
复出口申报：货物使用完毕后，凭 ATA 单证册中的白色复出口凭证向马来西亚海关申报，注明复出口货物项号及对应进口凭证号码，海关签注盖章后留存凭证，货物即可离境，务必妥善保管好该单证页。
国内复进口：货物运回上海等国内口岸时，使用黄色复进口凭证向海关申报，提交单证册供海关核对签注记录，审核无误后海关完成放行手续。
后续核销与特殊情况处理
正常核销：复运进境后尽快将 ATA 单证册退还至原出证机构，办理核销手续，确保单证册上的出入境签注完整。
续签处理：若需续签单证册，需由中国的担保机构致信马来西亚担保机构，申请马来西亚海关批准，获批意见会通过马来西亚担保机构反馈至中国出证相关机构，再完成续签流程。
异常处理：若货物超期复出口、未复出口或损毁，需向马来西亚海关补缴税费并获取完税证明、损毁证明等文件，核销时将这些文件与单证册一并提交，避免引发海关索赔。