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读博五年成质粒大师,一周 100 个,无酶切多片段组装,真快

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绝不绝,导师又安排我带着师妹构质粒,上周刚构完 100 个!

大师兄

博士延毕中

好家伙,你这成实验室质粒大师了啊!

沉迷构质粒

你这效率咋提上来的?我最近做的 3 片段组装总翻车,时间、经费都在燃烧,导师脸都绿了。

我用的无缝克隆预混液。片段丢进预混液,15 分钟温育直接完成组装,关键是不用找酶切位点,组装效率贼高!最近有免费试用,你们都试试

大师兄

还在为酶切位点匹配熬大夜?多片段组装总失败?NEB 最新推出快易无缝克隆预混液,15 分钟搞定载体构建,正好赶上 NEB 开学季超值促销:限时买 1 送 1,单次反应低至 ¥9.9(联系 NEB 一级代理商,可享优惠)。学霸君还给大家争取到试用福利,现在扫码 0 元领试用装,限量 50 份,千万不要错过哦!

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无缝克隆预混液到底什么原理?

NEB 快易无缝克隆预混液基于Gibson 组装原理开发,是一种高效、精准的体外 DNA 重组方法。该技术的核心在于利用多种酶的高度协同作用,在单次等温反应中实现多个线性 DNA 片段的无缝拼接。其具体机制可分为三步:

核酸外切酶从 DNA 片段的 5' 端进行切割,产生的单链突出末端(overhang)通过碱基互补配对相互结合,形成带有间隙(gap)的 DNA

DNA 聚合酶借助 DNA 合成过程填补上述间隙,形成仅含一个切刻(nick)的 DNA

DNA 连接酶通过催化磷酸二酯键的形成修复切刻,最终得到完整的双链 DNA,即质粒。

简而言之,NEB 快易无缝克隆预混液不需要特定酶切位点,直接在 DNA 片段末端加「魔术贴」(重叠序列),可突破 DNA 片段长度及末端序列,实现多片段高效组装。

预混液使用 Tips

1. PCR 引物设计和组装片段加样量:

强烈建议使用我们的在线工具NEBuilder® Assembly Tool来设计 PCR 引物,使其在相邻 DNA 片段之间具有重叠序列,以将其组装到克隆载体。如进行多片段组装,建议使用NEBuilder® Protocol Calculator计算模板加样量,提高装效率。

2. 高效组装技巧:

为确保成功组装以及后续成功转化组装的 DNA,NEB 建议遵循以下做法:

DNA:如果快易无缝克隆反应液中所有 PCR 产物的总体积不超过快易无缝克隆反应体积的 20%,无需进行 PCR 产物纯化。在组装三个或更多 PCR 片段时,或组装长度超过 5 kb 的片段时,强烈建议进行 PCR 产物柱纯化。用于组装的纯化 DNA 可溶于 ddH2O(推荐使用 Mii-Q® 水或同等纯度的水)、TE 或其它稀释缓冲液。

插入片段:直接将片段组装到克降载体中时,组装片段的浓度应比载体浓度高至少 2~3 倍。组装三个或更多片段时,建议使用等摩尔比的片段。

生物学特性:一些 DNA 结构,包括反向重复序列和串联重复序列,会被大肠杆菌选择性丢失。大肠杆菌无法耐受某些重组蛋白,因此可能会导致转化效率较低或菌落较小。

感受态细胞:推荐使用高效化学感受态细胞,如 NEB® 5-alpha E. coli 感受态细胞(高效级,NEB )。如果组装产物大于 10 kb,NEB 推荐使用 NEB 10-beta E. coli 感受态细胞(或 NEB 10-beta E. coli 电转感受态细胞)。反应产物可以直接加入细胞中,无需稀释,尽管进一步稀释反应混合物可能会提高转化效率。然而,当使用其他供应商的高效化学感受态细胞时,如果没有得到任何菌落,我们建议在转化前将反应混合物稀释 4。如果使用包括 NEB 在内的高效电转感受态细胞进行转化试验,我们建议将反应混合物稀释 3 倍。

电转化:电转化可以将转化效率提高几个数量级。将快易无缝克隆预混液产品用于电转化时,需要将反应液稀释 3 倍,并取 1μl 用于转化。

常见问题解答

FAQ:使用这种组装方法可以采用的重叠序列最短和最长长度是多少?

最短长度:已经证明,对于只有 12 bp 重叠末端的 DNA 片段也可以进行有效的组装。然而,这取决于重叠区域的 GC 含量。我们建议在对双链 DNA 进行组装时使用 15 bp 或更长的重叠序列且 Tm ≥ 48 °C(A-T pair = 2 °C,G-C pair = 4 °C)。

最长长度:快易无缝克隆预混液中的外切酶含量已经进行了优化,因此可以组装那些包含不超过 100-bp 重叠区域的 DNA 分子。

FAQ:可以 PCR 扩增组装的产物吗?

组装好的 DNA 分子是共价连接的,可以进行 PCR 扩增。此外,如果最终产物是闭合的环状 DNA 分子,它可以用作滚环扩增(RCA)的模板。

FAQ:使用快易无缝克隆预混液组装的 DNA 构建体适合用哪种类型的感受态细胞进行转化?

使用快易无缝克隆预混液组装得到的 DNA 构建体与大多数大肠杆菌感受态细胞兼容。NEB 推荐使用 NEB® 5-alpha E. coli 感受态细胞(高效级,NEB )。如果组装产物大于 10 kb,NEB 推荐使用 NEB 10-beta E. coli 感受态细胞(高效级,NEB )或 NEB 10-beta E. coli 电转感受态细胞(NEB )。

在生命科学研究的快节奏中,高效经济的克隆工具对加速科研突破至关重要。NEB 中国重磅推出无缝克隆神器快易无缝克隆预混液,15 分钟搞定克隆助您轻松告别繁琐操作,让您的灵感即刻转化为成果,赢得科研先机!点此即可申请免费试用

NEB 快易无缝克隆预混液核心优势

超快速度:15 分钟完成 2~3 个片段无缝克隆,快速呈现实验结果。

零纯化步骤:省去繁琐纯化流程,降低操作失误风险,节省试剂成本。

大片段兼容:支持长达 20 kb 的片段组装,满足多样实验需求。

灵活设计:自由定制序列,不依赖限制性酶切位点,实验设计更灵活。

广泛适用:适用于质粒构建、基因合成、定点突变等多种实验场景。

高性价比:20μl 反应体系,促销期间低至 9.9,减小体系更划算!

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促销倒计时:截止日期 2025 年 9 月 30 日!

内容策划:王丹琦

内容审核:吴军

题图来源:图虫创意

文中图片来源:NEB 官网截图

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