一、概念不同
航空运单是承运人与托运人之间签订的运输契约，也是承运人或其代理人签发的货物收据。航空运单不仅应有承运人或其代理人签字，还必须有托运人签字。航空运单与铁路运单一样，不是物权凭证，不能凭以提取货物，必须作成记名抬头，不能背书转让。
海运提单（BILL OF LADING--B/L）是承运人或其代理人应托运人的要求所签发的货物收据（RECEIPT OF GOODS），在将货物收归其照管后签发，证明已收到提单上所列明的货物；也是承运人所签署的运输契约的证明，提单还代表所载货物的所有权，是一种货物所有权凭证（DOCUMENT OF TITLE）。提单持有人可据以提取货物，也可凭此向银行押汇，还可在载货船舶到达目的港交货之前进行转让；是承运人与托运人之间运输合同的证明。
二、作用不同
空运提单
1、是证明承运人或其代理收到货物的收据：当托运人把货物交付承运人承运之后，由承运人或其代理人将空运提单的“托运人联”交给托运人，作为收到承运货物的收据。
2、作为运输合同的凭证：空运提单是空运托运人与承运人间运输合同的证明，是空运托运人与承运人间权利和义务的依据。所以，空运提单必须由双方签署后才能生效
3、作为运费帐单：航空运单可作为运费帐单和发票。因为它分别记载着属于收货人(或发货人)应负担的费用和属于代理的费用。承运人将运单的第二分正本(Originial-for the issuing Carrier)自己留存，作为运费收取凭据。
4、报关凭证：在航空货物到达目的地后报关时，航空运单通常是海关检查放行的基本单据。
海运提单
1、货物收据。提单是承运人签发给托运人的收据，确认承运人已收到提单所列货物并已装船，或者承运人已接管了货物，已代装船。
2、运输契约证明。是托运人与承运人的运输契约证明。承运人之所以为托运人承运有关货物，是因为承运人和托运人之间存在一定的权利义务关系，双方权利义务关系以提单作为运输契约的凭证。
3、货权凭证。提单是货物所有权的凭证。谁持有提单，谁就有权要求承运人交付货物，并且享有占有和处理货物的权利，提单代表了其所载明的货物。
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