1955年6月，“孙立人兵变案”开始发酵，经过一番调查，孙立人被认为负有多项责任。10月20日，蒋介石下令将孙立人交由“国防部”随时“察考”以观后效。
“孙立人兵变案”就这样草草了结，孙立人在当局“不杀、不审、不问、不判、不抓、不关、不放”的“七不政策”下，以软禁代替刑罪，与当初张学良如出一辙，开始了长达33年的幽居生活。
在台中市向上路18号孙立人个人购置的私人住宅里，孙立人过起了失去自由的生活。他接受了现实，调整好心态，从此在家读书写字，种花养草，有时还出去打打网球，日子过得倒也自在。
不过，他的一举一动都在监视之中，无法在公众前露面，也没有真正的自由。作为曾统帅千军万马的将军，如今却遭软禁，落差之大，孙立人心中的落寞是可想而知的。
孙立人被软禁后，陪伴在他身边的是第三位夫人孙美英。
他的第一位夫人是合肥举人龚彦师之女龚夕涛，两人于1919年结婚。由于是家庭包办婚姻，加上长期军旅生涯，孙立人对龚氏没有多少感情。龚氏是旧式女子，长期在老家侍奉孙立人父母，直到两位老人过世，对孙立人从无怨言。她在抗战期间也曾参加抗日活动，出任过合肥东乡青龙厂妇抗会理事长。
1947年孙立人从东北回南京开会，两人见了最后一面，解放后龚氏寄居在自己哥哥家，仍帮孙氏家族带小孩，于20世纪80年代在合肥去世。
孙立人与第二位夫人张晶英于1930年在上海结婚，张晶英出生于湘江之畔，在教会学校中长大，个性独特，性格豪爽，喜欢爬山、游泳、跳舞，两人婚后生活美满幸福。
美中不足的是军旅生活无定所，张晶英只得跟着丈夫到处流动。到台湾后，孙立人忙于公事，家中又无小孩，张晶英便与许多台湾妇女一样开始信佛，并为她的信仰而忙碌。她后来成为台湾著名佛教大护法师，法号清扬居士。
此时孙立人已年过半百，膝下尚无一男半女。张晶英遂作出了一项重要决定，为孙立人另娶一位妻子，自己则皈依佛门，奉佛终生。她替孙立人物色的新夫人就是张美英。
张美英是台湾高雄人，时年不满30岁，原是孙立人的家庭护士，工作踏实认真，深得孙立人夫妇的喜爱。张美英敬佩孙立人，孙立人也喜欢张美英的温婉贤淑，善良纯真。但婚后没多久就发生了“孙立人事件”。而孙立人一生清贫如戏，当年担任陆军总司令时，巨额特支费都做了部下在急难中的救济金，从无一文中饱私囊。
由于没有存款，没有工资，孙立人被幽禁后的最初三年连生活补贴都没有，家庭生活一下子陷入困境之中。
当时台湾盛行养鸡业，为补贴家用，张美英决定养鸡。孙立人亲自动手搭鸡棚，监护孙立人的副官帮他们买来了鸡仔，孙立人便在家里做起了鸡农，生了鸡蛋就由张美英拿到市场上去卖，一时间市上盛传“将军蛋”。后来养鸡人太多了，饲料价格飞涨，孙立人又改养起了金丝鸟。
张美英与孙立人结婚当年就生下长女，到1958年，家中已有两儿两女。收入不见增多，支出却倍增，这时孙立人已经有了一点生活补助，但仍是杯水车薪。得部下帮助，他们又设法在台中大坑买了一块山地，在山上栽种了荔枝、龙眼、柠檬、杨桃、芒果等果树。
有一个时期，每天清晨，孙立人都会和张美英带一壶水，几个馒头，几样小菜，上山除草施肥忙个不停，中午就在山上吃饭，直到月上西山才回家休息。果树结果之后，他们就将果子收摘清洗，次日清晨由张美英用自行车运到市场上去卖。
每年水果收获的季节，他们夫妇都忙得昏天黑地。而如此务农为生，终日劳作，虽辛苦劳累，却也成为他们排遣心头痛苦的一桩乐事。
随着孙立人年龄的增高，张美英对孙立人的照顾更是无微不至，每天亲手给丈夫做饭，嘘寒问暖，稍有疾病，便端汤进药不离左右。
古语道“天道无常，常与善人”，孙立人在被软禁的岁月中，有张美英作伴，张晶英也不时前来探望，又有儿女绕膝，苦在其中，也乐在其中。
将军不再指挥士兵，就把全部精力放在孩子身上，抚育他们成人。
孙立人最初失去自由时，长子孙安平出世了，大女儿孙中平刚刚4岁，后来孙天平、孙太平相继出生。孙立人以“中国平安，天下太平”为儿女命名，寄托心中的愿望。他也参与到养儿育女的工作中，从换尿布到请老师，他样样兼管。
孩子们渐渐长大了，先后上了大学。1974年，孙立人长女孙中平毕业于台湾清华大学，毕业后去美国深造，获得美国康奈尔大学材料工程学硕士，为IBM研究员，后任该公司自身集成电路工程师。
1980年7月4日孙中平在美国麻省理工学院结婚。作为父亲，孙立人不能前去主持婚礼，只好委托在加拿大大学任教的义子以义兄的身份带孙中平走进教堂，完成了终身大事。两年后，孙立人接到电话，知道女儿生了个宝宝，他喜出望外，在日记上写道：“82岁了，终得第一个外孙，岂不感慨！”
孙中平在IBM工作了22年，出任高管，她事业的高峰是在1999年以创纪录的80天便与宏基集团完成了80亿美元的采购及策略联盟合约。后来她回到台湾，在台积电继续当高管。
1977年，长子孙安平毕业于台湾中原理工大学，考入清大物理研究院，1979年获物理学硕士。孙立人获准参加毕业典礼，但不准发言和会客，孙安平后来获得美国南加州大学材料科硕士，后任集成电路网设计工程师。
1978年，次子孙天平毕业于台湾辅仁大学，接着获美国维拉诺凡大学电子计算机硕士，后任电路网设计工程师。1975年幼女孙太平考入台湾清大化学系，再赴美国杜克大学读遗传学博士，后任哈佛大学医学院博士后研究员。
孙立人的四个子女及收养的义子，全部从事科学教育工作，没有一个走从军或从政之路。
从子女有记忆以来，父亲孙立人就是被软禁的，但孙立人从不在家中提起被软禁与政治之事。据孙中平回忆，当时念台中师专附小时，听到同学家长指着她骂孙立人是叛国贼。小小的孙中平不解，回去问父亲，她只从孙立人口中得过一个答案：“告诉他们，我这辈子最崇拜的人就是岳飞，我这辈子从没做过一件对不起国家民族的事情。”
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