039型潜艇在设计中还注重降低整艇噪声水平，在动力机组上使用了减震浮阀技术（李老在接受杂志访谈中口述），大大降低了动力噪声水平。在尾部推进系统上大胆变革，摒弃落后的常规型潜艇多轴多桨的布局方式，采用水滴型潜艇的回转体锥尾，与单轴单桨十字舵形式，也让039型艇具有了更好的推进效率，配合7叶大侧斜螺旋桨的使用，让039型艇提高了静音航行速度，降低了螺旋桨空化噪音。而在艇体表面敷设的消声瓦，对于降低艇内噪音向外传递，削弱对方主动声呐声波反射强度，起到了重要的作用。这对于提高我国潜艇声隐蔽性是个开创性的进步。
由于这些先进的降噪技术的采用，我们有理由相信039型潜艇的噪声水平大大优于我国早期各型常规动力潜艇，相比也应该好于同时代的209型、阿哥斯塔型、春潮级等常规动力潜艇的噪音水准，而应与同样采用了减震浮阀与消声瓦技术的877EKM与改进型636型相接近。这是中国潜艇在降噪水平上的跨越性进步，很大程度上提高了中国常规动力潜艇的作战隐蔽性。
在武备上039型艇首布置了6具鱼雷发射管，通过最近公开的一系列039艇内部指挥舱的视频发现，039型艇应该装备了两具液压平衡鱼雷发射系统。这改变了我国常规动力艇只有气动不平衡鱼雷发射系统的局面，液压平衡式鱼雷发射系统的采用，也让039型艇获得了大深度发射鱼雷的能力，提高了039型艇潜航下的作战隐蔽性。同时最近在各种媒体上公布的039型艇装配鱼雷的图片也表明，039型艇装备了我国最先进的鱼-6热动力线导（具备主被动声自动、与尾流自导能力）鱼雷，鱼三乙等改进型电动力鱼雷，这些先进的鱼雷的使用也让039型艇获得了良好的打击敌潜艇、水面舰船的威力。而根据中央7台播放的039型艇在中俄联合军演中发射潜射导弹的视频表明，039型艇也装备了我国YJ82型潜射反舰导弹，这让我国常规动力潜艇在打击方式上更丰富，打击手段上更完备，提高了打击敌水面舰艇的能力。
总体来看039型艇的研制成功，改变了我国常规型潜艇落后与世界的局面，通过高起点的设计，诸多突破性新技术的采用，让我国的常规动力潜艇第一次接近了同时期世界先进常规动力潜艇水平。为将来设计新一代常规潜艇储备了人才，积累了丰富的经验。虽然039型艇研制过程中遇到了诸多的困难，并在艇体线型上有不够完善的地方，但是我国设计人员通过巨大的努力，在后续批次建造中逐渐完善了039型艇的设计方案，达到了该型艇的设计要求。039型艇是我国常规动力潜艇研制上获得突破性成果的潜艇，它奠定了我国研制具有国际先进水平潜艇的能力，为接下来我国常规动力潜艇赶超世界先进水平提供了良好的基础，在此我们向研制039型潜艇的研究制造人员表示崇高的敬意。
俄制基洛级常规潜艇，039型常规动力潜艇作战能力预计与俄制基洛级持平。
日本海自的亲潮级常规潜艇，注意其帆罩采用倾斜渐缩式设计以分散敌方主动声纳的反射波。
德国212A型常规潜艇拥有优美光滑的轮廓。德国人的潜艇制造水平和它的战车制造水平齐名。
下面是中国039型常规动力潜艇与日本亲潮级，俄罗斯基洛级，德国212A型潜艇的性能对比。这三种潜艇均为世界先进常规潜艇的典型代表。
下表是网易军事对039型潜艇的排名及国产化率评估，5星为满分：
本文来源：网易军事
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王晓易_NE0011
