在清华大学“百日大武斗”中
当历史步入1968年，在蒯大富出尽风头之时，清华大学另一派红卫兵组织正在迅速发展壮大起来。这个红卫兵组织也想要控制清华大学，因此，必然会和蒯大富领导的“井冈山兵团”发生矛盾。
一开始，两派组织之间还只是辩论。辩论中，你不服我，我也不服你。辩论双方都是年轻人，火气大，辩论中难免出现语言上的冲突，语言上的冲突又导致肢体冲突，直到大打出手。一开始，还是两派中几个人相互厮打，是小规模的冲突，但发展下来，冲突就越来越大了。你回去叫几个人来，我也回去叫几个人来，参加厮打的人越来越多，直到发展为大规模的武斗。
蒯大富一开始还约束自己手下人要“讲理”，要“忍让”，后来，他见对方势力越来越大，心中着急。这时，他听到了江青关于“文攻武卫”的讲话。江青这个讲话的意思是说：我们要用“文”的办法，去和修正主义斗争，但是，在斗争时，对方不服，用武力来打我，我怎么办？那就要用武力自卫。听了江青这个讲话，蒯大富心中有了底。同时，他也意识到，这些和自己对立的人，是想争夺清华大学红卫兵的领导权，想代替自己来左右清华大学的局势，对此，他岂能甘心？他决心把这股和自己争夺清华大学领导权的势力打压下去。他找到“井冈山兵团”的几个骨干商议之后，决定全兵团出动，给对方一些颜色看看。1968年5月，蒯大富组建了清华大学“井冈山兵团”文攻武卫总指挥部，指挥清华大学两派武斗。
行动时间定在5月29日。这一天，两派学生组织之间又发生了冲突，已经有了准备的“井冈山兵团”立即全员出动，他们手拿木棍、铁棍和其他一些劳动工具，从各个学生宿舍楼里冲了出来，一下子就把对方数百人包围起来，一顿乱打，把对方打得头破血流，有一些人求饶了，一些人则跑回去叫救兵。不一会儿，对方组织起一千多人，反扑过来。在楼顶上观察“战局”的蒯大富见对方主力出动了，一声令下，按他预先的布置，埋伏在各楼口高处的“井冈山兵团”的人，手拿石块、砖头，向对方狠狠砸去，把对方许多人打成重伤，对方急忙把自己受重伤的人抬回去。一千多人在抬伤员的过程中，被从四周楼内冲出的“井冈山兵团”的人分割包围，遭到一顿暴打，直打得许多人求饶，一些人则狼狈地跑了回去。这一仗，以“井冈山兵团”大获全胜而结束。蒯大富是这场武斗的指挥者。
但是，对方并不服输，他们重新组织力量，决心和“井冈山兵团”大打一场。不久，在清华大学就又发生了一场恶战。这场恶战发生在30日凌晨，天还没有亮，蒯大富就下令攻击反对蒯大富的学生组织， 对方也不示弱，对“井冈山兵团”进行反击。这场恶战，由于双方出动的人员很多，加上双方都有准备，所以，打得十分激烈。武斗双方都手执棍棒，从天明一直打到天黑，双方都有死伤。此次武斗致使18人死亡，1100多人受伤，30多人终生残疾，直接经济损失折合人民币逾1000余万元。清华的武斗同时也引起了北京大学、北京师范大学等校的大规模武斗。
蒯大富见自己方面也有死伤，手下的人也杀红了眼，就下命令，到学校大楼去，抢先把训练民兵用的武器拿到手，但对方也是这个想法，双方在抢学校大楼武器库时，又是一场厮杀。结果，由于“井冈山兵团”去的人多，抢到的武器比对方也多一些。
接着，双方便展开了有武器的武斗。他们各自占领了一部分学生大楼，把门窗都堵起来，不时地用武器射击对方。蒯大富还组织“井冈山兵团”的人，组成突击队，数次强攻对方所占领的大楼，经过几次强攻，把对方所占领的大楼中的多数攻打了下来，由“井冈山兵团”占领，只有两座大楼还在对方手中，对方的“司令部”也设在那里。蒯大富决定再仔细筹划，组织力量，一举把这两座大楼拿下。让蒯大富没有想到的是，多行不义必自毙，私欲膨胀的他指挥的这场武斗，使他迅速滑向毁灭的边缘。
武力抵制工宣队
原来，中央知道了清华大学等一些高校发生武斗并且有人员伤亡的情况后，决定立即制止这种情况发展下去。毛泽东做出决策，派由工人学习毛泽东思想积极分子组成“工人阶级毛泽东思想宣传队”，进驻一些高校，主要任务就是制止武斗，教育学生，实现大联合。此时，毛泽东对红卫兵的看法已经发生了重大变化，他认识到，学生们有革命热情，但还缺少社会经验，政治上还不成熟，“文革”中出现许多类如“打砸抢”的坏事，都是红卫兵们干的。我们国家是以工人阶级为领导阶级的国家，工人阶级觉悟高，能顾全大局，应该让工人阶级去教育学生。
这个决定做出以后，立即就行动起来，北京60多个工厂的3万多工人学习毛泽东思想积极分子很快就抽调齐了，不几天就组成了数支“工人阶级毛泽东思想宣传队”。清华大学是重点之一，自然也要派更多的“工宣队”进驻，同时还需要解放军的支持。在解放军支持下，“工宣队”很快就开到清华大学之外，就等着进驻清华大学了。
蒯大富得知这一消息后，立即决定关闭学校大门，暂且停止武斗。对方也停下手不打了。他们转而对付想要进驻清华大学的“工人阶级毛泽东思想宣传队”。至此，清华大学内部大武斗总算暂时告一段落。
在蒯大富指挥下，清华大学从1968年3月底发生小型武斗，发展到从5月29日到7月27日的大规模武斗，一共打了一百多天，这就是著名的“清华百日大武斗”。在这场“百日大武斗”中，对立双方各死伤多人。
但是，蒯大富并没有停止武斗，他只是把武斗的矛头指向了“工宣队”。
“工宣队”是由个个精干的工人组成的，加上有解放军的支持，紧闭的清华大门并没有把他们挡住。他们经过宣传，加上自己动手，很快就把大门打开了，于7月27日进入清华大学。
“工宣队”没有经过自己允许，就硬行进驻清华，这还了得？蒯大富恼怒了。他决定先给“工宣队”一个下马威。他派出许多“井冈山兵团”的人阻止“工宣队”进驻清华。“工宣队”是受到中央最高决策者指派而来的，又有解放军的支持，自然不会听蒯大富的指挥而轻易撤出，双方“顶牛”了。
蒯大富拿出了他指挥“清华百日大武斗”的疯狂，下令武力阻止“工宣队”进驻。他一声令下，手持长矛、枪支、手榴弹的“井冈山兵团”的人，向赤手空拳的工宣队发起袭击，有5名工人被打死，731人受伤。
震怒的毛泽东点了蒯大富的名
得知自己决定派出的“工宣队”进驻清华大学受阻，而且被打死5人，伤了731人，毛泽东震怒了。但是，这些人还是青年学生，当时红卫兵运动还受人关注，毛泽东不好派军队直接去清华大学抓带头闹事者，而且，对混乱中发生的事情，也需要调查清楚。但毛泽东心里十分清楚，红卫兵的领袖是制造事件的指挥者。要做好学生工作，使“工宣队”顺利进驻各高校，必须找红卫兵领袖们谈话，一方面严厉批评他们，给他们以警告，通过他们来做工作，另一方面也能当面了解情况。
1968年7月28日，毛泽东、林彪、周恩来和“中央文革”小组成员接见了聂元梓、蒯大富、谭厚兰、韩爱晶、王大宾这红卫兵五大领袖。
一见面，毛泽东就十分严肃。他并不掩饰自己的气愤之情。一见面，就直接批评红卫兵五大领袖说：你们一不斗，二不批，三不改，头脑膨胀。你们不听从指挥是不行的。你们要听从指挥。毛泽东在讲话中还专门点了蒯大富的名。这使蒯大富出了一身冷汗。林彪阴沉着脸，对红卫兵五大领袖表现出了少有的冷淡。毛泽东讲话之后，林彪用阴冷的目光扫了五大领袖一眼，只说了三句话：“工宣队”是毛主席决定派出的，你们敢打“工宣队”，后果由你们自己负责！周恩来在讲话中严厉批评红卫兵搞武斗，阻止“工宣队”进驻高校，是一个严重的问题，你们回去后，必须按中央要求，放下武器，拆除你们修建的武斗工事，迎接“工宣队”进驻学校，接受工人阶级的教育。江青等“中央文革”小组成员也出席了这次谈话会，他们虽然也为红卫兵开脱，但在当时毛泽东批评红卫兵五大领袖的意见十分明确的情况下，也不得不说几句批评红卫兵的话。
毛泽东等同红卫兵五大领袖的谈话长达五个小时之久，中心意思就是批评红卫兵，要他们听从指挥。这次接见，气氛严肃，狠狠地敲打了红卫兵五大领袖，对红卫兵是警告，也是约束。可以说，毛泽东这次同红卫兵五大领袖的谈话，是红卫兵运动的转折点。面对如此严肃的批评，过去威风十足的红卫兵五大领袖也只好承认错误，表示服从毛主席无产阶级革命司令部的伟大战略部署。
