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Cell Host & Microbe | 左涛课题组揭示肠道噬菌体肠型如何调控克罗恩病肠炎易感性差异

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克罗恩病(Crohn's disease,CD)是一种常见的炎症性肠病(Inflammatory Bowel Disease,IBD),以肠道慢性炎症为主要特征。其发病原因复杂,涉及遗传因素、环境影响和肠道微生物失调。随着生活方式的改变,克罗恩病的发病率在全球范围内持续上升,尤其在亚洲等地区已成为健康隐患。过去的研究多关注肠道细菌在疾病中的作用,但肠道噬菌体却鲜有深入探讨。噬菌体数量往往超过细菌,是肠道生态系统的“调节大师”,但它们如何影响克罗恩病的炎症差异,以及背后的机制,仍是医学领域的未解之谜。

2026年2月9 日,中山大学左涛研究员团队Cell Host & Microbe在线发表题为

Gut DNA virome enterotype dictates inflammation heterogeneity through tuning the phage-bacteria-sphingosine-intestine axis in Crohn
s disease
的研究论文 。该研究通过队列研究发现了人体肠道病毒组存在两种噬菌体“肠型”,并揭示了噬菌体“肠型”对肠道噬菌体-细菌微生态的调控新机制,及其对克罗恩病炎症表现的影响,为个性化开发噬菌体疗法治疗克罗恩病提供了新的视角。


这项研究采用多组学方法,包括噬菌体颗粒富集、高通量测序和代谢组学分析,对103名克罗恩病患者和105名健康志愿者的肠道黏膜和粪便样本进行了全面检测。研究发现,人类肠道黏膜噬菌体群可分为两种噬菌体“肠型”(enterotype):E1型和E2型。其中,E2型噬菌体群多样性更高,与细菌的关联更复杂,并在克罗恩病患者中占比显著增加。进一步分析显示,E2型患者肠道中一种名为 Wulffiauviviru s的噬菌体明显增多,这可能会加剧克罗恩病患者的肠道炎症。


随后,通过动物实验验证了这一发现:研究人员将人类E1型和E2型噬菌体群移植到小鼠体内,并在化学诱导的肠炎模型(DSS模型)中观察效果。结果显示,移植E2型噬菌体群的小鼠出现更严重的体重下降、结肠缩短和组织损伤,证实E2型噬菌体群具有促炎作用。同时,研究还分离了E2肠型中关键噬菌体φBTZT001P(属于 Wulffiauvivirus ),也在小鼠肠炎模型中证实其具有的促炎作用。

从机制上讲,φBTZT001P以溶原方式(即不杀死宿主而整合进细菌基因组)感染常见肠道细菌多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron),从而促进了细菌产生鞘氨醇(sphingosine,一种脂质代谢物)的能力。鞘氨醇随后抑制另一种有益细菌(Blautia obeum)的生长,导致肠道生态失衡,进一步加剧炎症。这一“噬菌体-细菌-代谢物-肠道轴”的发现,揭示了肠道噬菌体群如何通过微妙的跨界互动调控肠道菌群从而影响克罗恩病的的炎症表现。


综上所述,本研究通过多组学手段及动物模型,阐明了肠粘膜噬菌体群特别是温和性噬菌体如何跨界调控宿主细菌功能从而重塑肠道微生态的新机制,以及揭示了不同噬菌体肠型人群对于克罗恩疾病的易感性的影响,从而为基于肠菌/噬菌体移植治疗克罗恩病的个性化治疗提供科学依据。

中山大学附属六院左涛研究员为该论文通讯作者,中山大学附属六院博士后温炜杰为第一作者。

原文链接:https://www.cell.com/cell-host-microbe/abstract/S1931-3128(26)00041-7

制版人: 十一

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