在疾病确定的情况下,选表型、定基因是课题展开的基础。靶基因的获取是研究的开始。除了做二代测序和单细胞多组学测序外,CRISPR文库筛选是更常用的策略。而且,与其他筛选手段相比,文库筛选体系性价比更高、特异性更高、与表型关系更确切。自从2012年体外编辑以来,文库筛选已经发表不少顶刊论文。
MHC-I类分子参与肿瘤抗原递呈,是抗肿瘤免疫的关键。在肿瘤免疫领域,PCSK9调控MHC-I类分子的研究备受关注,而且在临床上有降血脂、抗肿瘤的双重作用,是极有前景的靶点。
![]()
2023年8月,纽约大学格罗斯曼医学院王俊教授、Iannis Aifantis教授在Cell期刊发表题为A membrane-associated MHC-I inhibitory axis for cancer immune evasion的论文。为了系统地研究调控MHC-I类分子的关键基因,研究人员使用特定的MHC-I抗原肽展开CRISPR-Cas9筛选。
![]()
急性髓系白血病 (AML)细胞起源于可以分化为抗原递呈细胞的髓系细胞,在这些细胞系上发现的抗原递呈机制很有可能存在于其他肿瘤类型。在筛选过程中,研究人员发现排名靠前的负调节因子包括表面蛋白sushi domain containing 6 (SUSD6),跨膜蛋白127 (TMEM127),以及E3泛素连接酶WWP2。其中,TMEM127为四次跨膜蛋白,与神经内分泌肿瘤易感相关,也被认为是一种Nedd4家族E3连接酶适配器,在沙门氏菌效应蛋白SteD存在下降解MHC II。SUSD6为单次跨膜蛋白,其免疫相关功能未见报道。
![]()
研究发现,在SUSD6缺失时,细胞膜表面MHC-I的表达会增强,促进急性髓系白血病(AML)和实体瘤中 T 细胞介导的抗肿瘤免疫。在小鼠AML模型中,SUSD6缺失显著延缓了白血病肿瘤的生长,延长了小鼠生存期,而且这种抗肿瘤活性主要依赖于CD8+ T 细胞。而且,在多种实体肿瘤细胞系中,SUSD6敲除显示出类似的结果。
![]()
![]()
生信数据挖掘发现,SUSD6在多种肿瘤中高表达,并且其表达程度与患者生存率负相关。SUSD6表达还与肿瘤微环境的 T 细胞激活特征负相关,提示SUSD6是一个具有临床价值的新型免疫调节分子,其中用到GEPIA做差异分析!
![]()
机制研究发现,SUSD6敲除不影响MHC-I的转录和翻译,但MHC-I蛋白表达显著上调。因此,作者猜测SUSD6参与调节MHC-I降解。实验证明,SUSD6促进细胞表面MHC-I进入溶酶体降解,但不影响MHC-I的胞内贮存和再循环。
![]()
SUSD6和TMEM127两个膜分子可以同时与MHC-I直接相互作用,并招募E3泛素连接酶WWP2,从而形成一个四元复合物。WWP2在SUSD6和TMEM127存在的情况下介导了MHC-I泛素化以及溶酶体降解,从而降低MHC-I在细胞表面表达。
![]()
另外,通过敲除四元复合物中另一个重要分子,TMEM127,发现得到的表型与敲除SUSD6类似,从而揭示了靶向四元复合物分子进行抗肿瘤免疫治疗的可能性。需要注意,虽热SUSD6和TMEM127可与MHC-I类分子直接相互作用,但是并不参与MHC-I类分子降解。因此,只有在SUSD6、TMEM127和WWP2均表达的情况下,MHC-I类分子才会发生降解,上述三种分子在肿瘤中的表达具有普遍性吗?这是个问题!
![]()
因此,比较而言,个人认为PCSK9的临床应用价值更大。但是,这篇文章的筛选策略和流程是值得我们学习和借鉴的。见贤思齐,取其长处,把这篇文献推荐给大家!
特别声明:以上内容(如有图片或视频亦包括在内)为自媒体平台“网易号”用户上传并发布,本平台仅提供信息存储服务。
Notice: The content above (including the pictures and videos if any) is uploaded and posted by a user of NetEase Hao, which is a social media platform and only provides information storage services.