广东
近日，西北农林科技大学果树病害致灾机理及综合防控团队在Molecular Ecology Resources上发表了题为“High-Quality Genome Assembly of Diplocarpon coronariae Unveils LTR Retrotransposon-Driven Structural Dynamics in Fungi Evolution”的研究成果。西北农林科技大学博士研究生高承宇为论文的第一作者，黄丽丽教授和冯浩教授为论文的通讯作者。
长末端重复反转录转座子（LTR-RTs）是真核生物基因组进化的重要驱动力，但其在真菌染色体水平上的进化调控机制尚不明确。该研究以苹果褐斑病致病真菌冠双壳菌（D. coronariae）XN1菌株为材料，完成了其端粒到端粒（T2T）级别基因组组装，并结合转录组数据与人工校验获得高精度全长转录本。基于高质量基因组与基因结构注释，该研究鉴定了冠双壳菌的双速基因组特征，并构建了图泛基因组。比较基因组学分析表明，LTR-RTs通过引起序列与结构变异促进了冠双壳菌菌株间的分化。基于锤舌菌纲（Leotiomycetes）多物种基因组的基因家族分析显示，LTR-RTs不仅参与物种特异性基因家族的形成，还驱动了基因家族的扩张。进一步的种间比较分析发现，冠双壳菌中特异性存在的年轻染色体Chr15可能起源于保守的拓扑关联结构域（TADs），并随着LTR-RTs的爆发式插入而扩展形成。
染色体形成新机制模式图
https://doi.org/10.1111/1755-0998.70070
特别声明：以上内容(如有图片或视频亦包括在内)为自媒体平台“网易号”用户上传并发布，本平台仅提供信息存储服务。
Notice: The content above (including the pictures and videos if any) is uploaded and posted by a user of NetEase Hao, which is a social media platform and only provides information storage services.
