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产品名称:VIC亚磷酰胺的关键反应特性
1. 结构组成与化学特性
核心结构:
分子式:C₅₂H₅₉Cl₃N₃O₁₀P,分子量1023.38。由VIC荧光染料(罗丹明类结构,含黄嘌呤骨架与二芳基取代基)与亚磷酰胺基团(–P(NiPr₂)O–)偶联构成。
功能基团:亚磷酰胺基团支持与寡核苷酸链的3'-或5'-端共价连接,形成稳定磷酸三酯键;VIC染料提供黄绿色荧光(激发波长526–552 nm,发射波长543–568 nm),量子产率高且光稳定性良好。
物理性质:粉红色/紫色固体,溶于DMSO、DMF等有机溶剂,需-20℃避光干燥保存,避免反复冻融。
2. 关键反应特性
荧光标记能力:通过固相自动化DNA/RNA合成仪,在寡核苷酸合成过程中直接引入荧光标记,支持5'端或内部位点特异性标记,不影响核酸杂交功能。
化学选择性:亚磷酰胺基团与固相载体(如CPG)反应迅速,避免非特异性副反应;兼容标准DNA合成条件(如弱碱性环境、碘氧化步骤)。
稳定性优势:耐酸碱(pH 4–10),耐受常规脱保护与氧化条件;长期保存需避光低温,避免荧光淬灭。
3. 应用场景
分子生物学研究:
实时定量PCR(qPCR):作为TaqMan或MGB探针的荧光报告基团,用于多重荧光检测(如SNP分型、病毒RNA检测),与FAM、NED、ROX等荧光团光谱区分。
荧光原位杂交(FISH):标记寡核苷酸探针,用于染色体定位、基因表达分析。
DNA测序与微阵列:构建荧光标记引物或探针,支持高通量基因分型与核酸成像。
诊断试剂开发:适用于商业诊断试剂盒(如肿瘤标志物检测、病原体核酸筛查),提升检测灵敏度与信噪比。
生物成像与材料科学:结合点击化学(如CuAAC)修饰纳米颗粒、生物聚合物,或用于细胞内核酸追踪、药物递送系统标记。
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