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从 2900 种抗体到临床突破:YAbS 数据库如何改写医药研发规则?

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摘要:治疗性抗体已成为现代医学的核心力量,但其研发过程复杂且数据分散,给科研和产业带来巨大挑战。YAbS 数据库作为全球领先的治疗性抗体资源平台,整合了 2000 年以来超过2900种商业化研发的候选抗体信息,涵盖从早期临床到获批上市的全生命周期数据。本文系统介绍了YAbS的建立背景、数据结构、搜索功能及实际应用案例,揭示其如何为研究者、医生和企业提供临床开发趋势成功率分析分子设计灵感通过解读数据库中的关键数据,我们能清晰看到治疗性抗体从传统单抗向双特异性抗体抗体药物偶联物(ADC)等复杂格式的演变,以及中美企业在研发中的主导地位。无论你是医药从业者还是科研人员,YAbS 都将成为探索抗体治疗学的“必备工具”。一、引言:为什么我们需要 YAbS 数据库?

在过去 40 年里,治疗性抗体从实验室概念逐步成为癌症、自身免疫病等重大疾病的 “克星”。从 1986 年首个单抗药物获批,到如今全球已有超过 100 种抗体疗法上市,这类药物凭借精准靶向低毒副作用的优势,成为生物制药领域的 “顶流”。

然而,随着研发加速,一个关键问题日益凸显:如何高效追踪全球数千种候选抗体的进展?不同企业的临床阶段分子格式靶点抗原等数据分散在公司官网、临床试验登记处和学术文献中,研究者往往需要花费数月整理信息。更重要的是,临床成功率开发周期等核心指标的缺失,让资源投入决策充满盲目性。

为解决这一痛点,国际非营利组织“抗体学会(The Antibody Society)”历时 13 年打造了YAbS 数据库( https://db.antibodysociety.org )。它不仅是全球最大的商业化抗体疗法数据库,更首次实现了从分子设计到监管审批的 “全链条数据整合”。截至 2025 年 1 月,YAbS 已收录 2900 余种 2000 年以后进入临床的候选抗体,其中 450 余种获批、处于监管审查或晚期临床阶段的数据向公众免费开放,成为医药研发的“导航系统”。

二、YAbS 数据库:从数据收录到结构设计2.1 哪些抗体能进入 YAbS?

YAbS 的 “准入门槛” 十分严格。它只收录新型治疗性重组蛋白—— 必须包含至少一个来自抗体基因的抗原结合位点,由企业研发或授权,且首次临床时间在 2000 年 1 月 1 日之后。不过,对于 1980-1990 年代进入临床但最终获批的 “元老级” 抗体(如 1998 年获批的赫赛汀),数据库也破例收录。

与此同时,6 类分子被明确排除:

生物类似药(并非创新分子);

仅用于诊断的抗体;

天然来源的多克隆抗体

不含抗体结合位点的相关分子(如 Fc 融合蛋白、DNA 编码抗体);

非企业主导的临床研究抗体;

2000 年前进入临床且未获批的抗体。

这种严格筛选确保了数据的创新性商业相关性,让研究者能聚焦真正有潜力的新药候选者。

2.2 数据从哪里来?如何保证时效性?

YAbS 的数据团队每天从 10 余种公开渠道收集信息:

企业官网、新闻稿和财报;

临床试验注册平台(如 ClinicalTrials.gov);

监管机构公告(FDA、EMA 等);

世界卫生组织(WHO)的国际非专利药名(INN)清单;

开源数据库(如 TheraSAbDab、IMGT/mAb-DB)及学术文献。

为跟上研发节奏,数据库每 2 个月更新一次,确保临床阶段变化靶点更新企业合作动态等信息及时反映。例如,某抗体从 II 期推进到 III 期的消息,最快可在 1 个月内录入系统。

2.3 数据如何分类?看懂 “分子身份证”

YAbS 为每种抗体建立了详细的 “分子档案”,核心分类包括:

分子格式:分为全长抗体、抗体片段(如 Fab、scFv)、片段 - Fc 融合体等,还标注是否为裸抗体、偶联物(如 ADC)或融合蛋白(图 1);

特异性:单特异性、双特异性(靶向不同抗原或同一抗原的不同表位)或多特异性;

作用机制:如阻断剂、激动剂、细胞介导的效应功能等;

临床状态:从临床前、I 期到获批,甚至包含 “终止开发”“撤回” 等状态;

治疗领域:按癌症、免疫介导疾病、心血管病等细分。

这种标准化分类让不同抗体的横向对比成为可能。例如,研究者可一键筛选 “靶向 BCMA 的双特异性抗体且处于 III 期临床” 的所有候选药。

三、手把手教你用 YAbS:从搜索到分析3.1 4 种搜索方式,满足不同需求

YAbS 的界面设计兼顾了新手和专家(图 1):

快速搜索:按靶点、治疗领域或企业名称查询(如输入 “HER2” 可找到所有相关抗体);

高级搜索:支持多条件组合,如 “分子类别 = ADC + 治疗领域 = 乳腺癌 + 阶段 = III 期”(图 1b);

日期筛选:独特的时间轴功能,可按 “首次人体试验启动时间”“BLA 提交日期” 等筛选,轻松追踪研发时间线

自由文本搜索:在任何字段中查找关键词(如 “中国企业”“FDA 突破性疗法”)。

3.2 搜索结果怎么看?图表 + 表格一目了然

点击搜索后,结果页会自动生成 4 种饼图(图 2):

总体状态分布(如获批、临床中、终止);

分子类别占比(如 ADC、双特异性抗体);

治疗领域分布;

靶点分布。

下方表格则展示具体抗体信息,支持自定义列(如显示 “企业所在地”“Fc 亚型”)、排序和导出。点击每条记录的 “YAbS ID”,可进入该抗体的专属页面,查看关键时间节点(如 I 期启动日、获批日)、企业合作信息甚至终止开发的原因(图 2)。

3.3 案例:3 步找到 “HER2 靶向 ADC” 的研发趋势

在高级搜索中选择 “分子类别 = ADC”“靶点 = HER2”;

时间筛选设为 “2010-2023 年首次人体试验”;

查看结果中的趋势图:可见 2018 年后 HER2-ADC 的研发数量显著上升,且多为双特异性 ADC(图 4c)。

四、YAbS 揭示的 3 大行业真相4.1 临床阶段全景:过半抗体仍在 “闯关”

对 2709 种进入临床的抗体分析显示(图 3a):

55% 处于活跃临床阶段(1505 种),其中近 3/4 停留在 I 期或 I/II 期(图 3b);

66% 用于癌症治疗,远超其他领域(图 3c);

研发主力来自中国和美国企业,占比超 60%(图 3d)。

这意味着早期研发失败率仍较高,且癌症仍是抗体疗法的 “主战场”。

4.2 13 年趋势:双特异性抗体和 ADC 成 “新宠”

2010-2023 年的首次人体试验(FIH)数据显示(图 4):

年度 FIH 数量从 2010 年的不足 50 种增至 2023 年的 300 余种,2016、2019 年出现短暂下滑(可能与企业预算调整有关);

双特异性抗体和 ADC 的占比从 2010 年的不足 10% 升至 2023 年的 35%,取代传统裸单抗成为研发热点(图 4b);

HER2 靶向抗体的 “家族” 不断扩大,从早期的裸单抗发展到 ADC、双特异性 ADC 等(图 4c)。

4.3 研发周期:癌症抗体比非癌症抗体快 1 年

对 103 种 FDA 获批抗体的分析发现(图 5):

癌症抗体的总研发周期(从 IND 到获批)平均为 8 年,非癌症抗体则需 9 年;

差异主要来自晚期临床和监管审查阶段 —— 癌症药更易获得 FDA 的 “突破性疗法” 等加速资格;

非癌症抗体中,免疫介导疾病的研发周期最长(近 10 年),心血管疾病最短(不足 7 年)(图 5d);

癌症抗体中,裸单抗的研发周期(9 年)比 ADC(7.5 年)和双特异性抗体(7 年)更长(图 5f)。

五、YAbS 的价值与局限5.1 为什么它不可替代?

相比其他数据库(如 DrugBank、IMGT/mAb-KG),YAbS 的优势在于:

商业视角:专注企业主导的研发,更贴近产业实际;

动态更新:双月更新确保数据时效性;

全链条数据:从分子设计到监管审批的完整记录,支持成功率计算;

开放共享:晚期临床和获批数据免费开放,降低中小企业和学术界的使用门槛。

5.2 这些 “短板” 需要注意

早期数据不全:企业常隐瞒临床前或 I 期抗体的细节(如靶点、偶联物);

地域偏差:欧美企业数据更透明,部分地区企业信息较少;

不包含非企业项目:学术机构或非营利组织的研发未被收录。

六、结语:YAbS 如何改变医药研发?

YAbS 不仅是一个数据库,更是治疗性抗体研发的 “晴雨表” 和 “决策助手”。它让研究者能快速定位竞争格局(如“我的靶点已有多少竞品进入 III 期”),帮助企业优化资源分配(如“ADC 在某领域的成功率更高”),为监管机构提供行业趋势参考。

随着双特异性抗体、ADC 等复杂分子的崛起,以及 AI 设计抗体的普及,YAbS 的价值将进一步凸显。未来,它可能纳入真实世界数据生产工艺信息等,成为连接实验室到病床的 “超级平台”。

对于医药从业者而言,学会用 YAbS,就等于掌握了研发效率的密码 —— 毕竟,在瞬息万变的抗体领域,谁先看透数据,谁就能抢占先机。

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