单细胞转录组结果能够分析的角度和层次都是十分丰富的,测序公司给出的标准分析完全不能满足发表高分文章的需要。从另一个角度来说,只要自己掌握了分析技能,对测序数据进行深入挖掘,那么高分文章也就手到擒来了!
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为了让0基础学员也能掌握单细胞转录组的分析技能,暑期组学大讲堂将举办《单细胞转录组分析实操》(杭州站)线下培训(8月14日-16日),软件、代码、资料永久免费,手把手教你单细胞转录组数据分析,攻克核心分析技术,助力你高效发文章!
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6大课程硬核优势
优势1:内容全面:涵盖一区、二区文章常用分析条目,一课掌握核心技能
优势2:零基础友好:针对初学者设计,数据整理完善后,复制粘贴即可分析
优势3:分析不挑设备:采用docker虚拟机教学(国内首创),无需安装软件,好学好用
优势4:电脑要求低:云服务器教学,指令发送由服务器处理,个人电脑可正常办公
优势5:售后无忧:2年超长时间售后答疑,学习全程无忧
优势6:图表颜值高:紧跟文献最新趋势,使用最新R包绘图,生成高颜值、信息量丰富的图表,直接用于文章撰写
丰富课程内容详解
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第一节 | 单细胞转录组介绍
单细胞测序技术发展历程与前沿研究现状
单细胞转录组CNS顶刊文章思路解析
单细胞转录组技术在不同科学等领域的研究内容及思路及常见图形解读
️第二节 | Linux入门学习与单细胞生信分析环境搭建
Linux系统简介(bash,内核,命令行界面等)
Linux基础命令学习(cd、ls、awk、grep等)
Docker运行原理、学习镜像使用、容器管理相关命令
一键搭建单细胞转录组分析环境
R语言简介
R语言安装环境搭建与R扩展包安装
数据结构、数据读入与写出、逻辑判断等
常用方法介绍(求和,数据合并,数据筛选)
R语言绘图基础(ggplot2)
单细胞测序数据介绍与cellranger分析单细胞数据
GEO公共数据库单细胞转录组数据读取
单细胞数据质控、多种标准化处理、PCA降维、聚类、tSNE、UMAP可视化,双细胞去除,亚群纯度分析,多个样本整合
细胞亚群自动注释方法以及手动注释
第五节 | 单细胞Marker基因深度解析
差异基因分析,marker基因分析
GO、KEGG、GSEA富集分析及可视化
Marker基因表展示:绘制小提琴图、散点图、山脊图、火山图、热图、气泡图等
多个重复的细胞类型比例展示
第六节 | 单细胞转录组高级分析(1)
细胞通讯分析原理讲解结果解读及可视化:cellchat
RNA速率分析原理讲解结果解读及可视化:scVelo
拟时序分析讲解及可视化:monocle3
转录因子分析:pySCENIC 转录因子活性分析
细胞打分分析:GSVA,ssgsea,Ucell,,AUCell,cytotrace等
hdWGCNA共表达网络分析:基因共表达模块分析,模块与表型关联分析
第八节 | 单细胞转录组高级分析(3)
肿瘤拷贝数推断inferCNV
肿瘤细胞亚型分析
亚克隆进化分析
本期课表:
报名福利:
✅ 赠送价值700元的组学大讲堂云服务器3个月的使用权
✅ 团报优惠:2人及以上减200元/人
⏰ 报名信息:
开课时间、地点:2025年8月14日-16日(杭州线下)
原价:4480元 | 早鸟价:3980元
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测序、数据分析、课程培训等事宜请联系邮箱:Tech@biomics.com.cn
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