山东
有机物料腐熟菌是不致病的微生物，含有一种或多种能降解纤维素、木质素、蛋白质等大分子的酶类。在适合的温度和湿度下，附着于秸秆表面的腐熟菌，分泌纤维素酶，将纤维素分解成小分子的葡萄糖，并吸收这些糖类进入菌体细胞成为进一步繁殖所需要的能量和组成新菌体的物质。
腐熟菌分泌的木质素酶分解木质素，土壤中的微生物利用木质素分解产生的小分子物质合成腐殖酸是一个比较复杂的过程，腐殖酸增加土壤保肥保水能力，还有一定刺激植物生长的作用，这个多步反应过程目前还不十分清楚。
这些腐熟菌遇到蛋白质就会分泌蛋白质酶，将蛋白质分解为小分子的氨基酸。这些氨基酸有相当一部分直接被植物吸收。在微生物菌体分泌
不同酶分解秸秆中的大分子物质形成葡萄糖、氨基酸等小分子物质时，还会产生许多含碳的中间产物，小分子量的可以被植物直接吸收。这些能被吸收的含碳物质常被俗称为“碳肥”。
在日照不够、光合作用很低的地区，它们就显示抗低日照的生理功效，可以使作物黄化现象降低。这些中间产物还可吸附一部分重金属，使农作物所帶的重金属含量有所下降。
不添加腐熟菌剂，让畜禽粪便、秸秆等农业废弃物自然堆置、沤制，这个过程臭气熏天，需时长久，一般要半年以上，还有被病原菌污染的风险。
使用腐熟菌剂一定要同时使用有机肥或尚未腐熟的有机秸秆或畜禽粪便，腐熟菌剂才有工作对象。缺少秸秆等有机物质的砂质土壤、板结土壤，单独使用腐熟菌剂而不同时配施有机废弃物效果是不明显的。
如果在治沙地区配合秸秆和腐熟菌剂，同时抓住降雨季节或灌水措施治沙，效果可以倍增，种植的抗风沙植物成活率大为提高。腐熟菌剂在降解秸秆等有机物料时，由于微生物作用产生的生物能可提高地温，在早春和深秋延长种植期也有一定的意义。
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