嵌入式系统架构有两大体系，即CISC(复杂指令集计算机)和RISC(精简指令集计算机)。虽然它们都是试图在体系结构、操作运行、软件硬件、编译时间和运行时间等诸多因素中做出某种平衡，以达到高效的目的，但采用方法不同，因此在很多方面差异很大，通常X86架构采用CISC,而ARM采用RISC。也就是常见的两大嵌入式主板种类：基于x86架构的嵌入式主板，Arm架构的嵌入式主板。
无论Arm或X86主板其制造成本都是由元件和加工费构成，通常一片ARM的主板价格与一片X86主板的价格差不多，但ARM是一片可以独立使用的产品，但x86主板通常还要加上：CPU、内存、硬盘甚至还有显卡。 另外，X86还要配上一个电源，这个电源比ARM得电源要贵很多。所以：明显X86在硬件方面的应用成本比ARM高得多。
RISC特点：
1.统一指令编码（例如，所有指令中的op-code永远位于同样的位元位置、等长指令），可快速解译；
2.泛用的暂存器，所有暂存器可用于所有内容，以及编译器设计的单纯化（不过暂存器中区分了整数和浮点数）
3.单纯的寻址模式（复杂寻址模式以简单计算指令序列取代）
4.硬件中支援少数资料型别（例如，一些CISC电脑中存有处理字节字串的指令。这在RISC电脑中不太可能出现）。
CISC特点：
1.指令系统庞大，指令功能复杂，指令格式、寻址方式多；
2.绝大多数指令需多个机器周期完成；
3.各种指令都可访问存储器；
4.采用微程序控制；
5.有专用寄存器，少量；
6.难以用优化编译技术生成高效的目标代码程序；
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