随着波罗的海舰队的全军覆没，沙俄终于放弃了继续作战的打算，谋求与日本和谈。而日本虽然节节获胜，但实际上国内经济已经濒临崩溃。因此，两国在美国的斡旋下坐上了谈判桌。
俄、日都对战争精疲力竭，只得谈判
日本急切地希望凭借这次战争狠狠的宰沙俄一刀，提出了一系列如让出东北一切权益；割让外兴安岭、海参崴和库页岛以及巨额赔款等要求。这些要求显然超出了沙皇尼古拉二世的底线，因此他强硬地表示既不割地也不赔款，否则可以继续战争。
此时沙俄的最精锐的陆军还在欧洲未受损失，而海军的北海舰队和黑海舰队加起来的实力也高于联合舰队。而日本陆军已经战死了八万多人，更有十万人因为受伤而残废。国内粮食、燃油因集中供应军队而价格暴涨，已经引发了日本平民的多次抗议。因此日本政府不得不妥协。最终，沙俄承认全朝鲜均为日本势力范围，将除了满蒙铁路北段的所有在东北的权益转交给日本，割让库页岛南部给日本。
俄军陆海军仍有继续战斗的余力
滑稽的是，虽然日本名义上获得了半个东北的控制权，但是由于其在战争中实力损失太大，使得其无力控制这些地区。最终只实际控制了旅顺、大连和满蒙铁路沿线的部分地区。而东北大部分地区实际上又回到了清政府的控制之下。
然而需要明确的是，虽然清政府坐收了渔翁之利，但是日俄战争让我国东北的人民蒙受了极大的痛苦。为了筹措军需，俄军、日军蛮横地劫掠我国平民；许多中国人民被两个侵略者强征为劳工，因劳累而死。整个日俄战争期间，有数十万人沦为难民，以至于''小民转徒流离哭号于路者，以数十万计''。
被俄军强迫做苦力的中国人民
沙俄的腐朽和脆弱在这场战争中暴露得淋漓尽致，虽然动员的部队远多于日军，但是各个集团间完全没有协同配合可言，最终被日军分别消灭。许多官员将派系斗争置于国家利益之上，为了打击政敌不惜给其使绊子，让其打败仗。这次战争沙俄扩张不成，反而损失了大批殖民地，国内的各种矛盾被激化，工人运动开始蓬勃发展，这为之后苏俄的建立奠定了基础。
日本虽然赢得了战争的胜利，但是各类情况也很不乐观。在古代日本，只有武士阶级才有权利参军作战，因此虽然古代日本战争不断，但是由于平民不配参战，因此战争对平民的直接伤害还是相对有限的。明治维新之后，武士的特权被废除，日本所有国民都被赋予了参军的义务和权利。这虽然帮助日本建立起了强大的部队，但也让日本百姓第一次直接承担了战争的恐怖和代价。
虽然日本仍然在日俄战争中攫取了不少利益，但是没能获取足够的现金来缓解国内的财政危机，而平民显然不了解异国他乡的铁路和港口有什么重大意义，因此产生了高度不满，他们纷纷指责当时的日本大本营妥协卖国，各类抗议和冲突此起彼伏。这大大推动了日本的法西斯主义发展，催生了后来的二二六兵变等一系列事件，最终推着日本走上了疯狂扩张、自取灭亡的不归路。
日本陷入更加疯狂的境地
一场战争，最终成为了三个国家的国耻，深远地改变了东亚的政治格局。
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