大蛇丸的身边，药师兜终于找到了自己存在的意义。那就是陪伴在大蛇丸身边，帮助大蛇丸实现研究忍术的愿望，甚至因此搭上自己的性命也在所不惜。记得大蛇丸急需转生的新容器时，药师兜还主动表示愿意成为大蛇丸的新容器。在大蛇丸身边，药师兜的医疗忍术得到了淋漓尽致的发挥，不断帮助大蛇丸救治奄奄一息的活人实验体。
漩涡香磷：前期漩涡香磷也是大蛇丸的试验品之一，大蛇丸看中香磷的能力就是漩涡一族的力量了，在前期香磷并不知道她拥有这样的能力，在大蛇丸心里香磷也是非常重要的徒弟之一，他并没有使用不尸之术夺走香磷的身体，在忍者大战中，香磷的漩涡一族能力也觉醒了，而到了博人传中，漩涡香磷并没有和佐助走到一起。她还是选择了大蛇丸，也许大蛇丸才是他最好的归属。
二柱子是大蛇丸最喜欢的一个弟子了，对于这个弟子，大蛇丸应该是又爱又恨。爱的是他的能力跟写轮眼的血继限界，恨的是佐助是不会轻易被操纵的，如果想要把佐助当做容器，大蛇丸且得努力一阵子。而且最后大蛇丸还是死在了二柱子的剑下。
宇智波信是大蛇丸的实验体，也算是大蛇丸曾经的部下，由于拥有特殊的体质，能够接受一切能力的移植。宇智波信成功开启了万花筒，拥有远程操纵物体的能力，而且掌握了高端的克隆技术。当初宇智波信让忍界最强的鸣佐吃了不少苦头，从实力来看，宇智波信绝对是接近影级的存在。
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