蛋白激酶作为细胞内信号转导的核心调控分子,其异常激活与肿瘤、炎症、自身免疫疾病等多种病理状态密切相关。激酶抑制剂已从伊马替尼时代的"偶然发现"演变为当今肿瘤精准治疗的主力方向,而高效、系统的激酶靶点筛选平台则是这一领域持续创新的基础设施。北京爱思益普生物科技股份有限公司建立了1000余种酶学靶点的筛选平台,涵盖激酶、磷酸酶、蛋白酶等多个酶家族,配备BaF3细胞增殖检测体系和激酶谱筛选服务,为创新药研发提供从靶点验证到先导化合物优化的全流程技术支持。
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激酶家族:可成药性靶点的富矿
人类基因组编码超过500种蛋白激酶,构成细胞内最庞大的信号调控网络。激酶通过催化ATP的磷酸基团转移至底物蛋白的丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸残基,实现信号的快速放大与传递。MAPK通路(Ras-Raf-MEK-ERK)调控细胞增殖与分化,PI3K-AKT-mTOR通路控制细胞代谢与存活,JAK-STAT通路介导细胞因子信号,而CDK家族则驱动细胞周期的进程。当这些通路因基因突变、扩增或易位而被持续激活时,细胞将失去正常的增殖控制,向恶性转化。
激酶的可成药性源于其保守的ATP结合口袋。尽管不同激酶的催化域结构高度相似,但ATP口袋周围的非保守区域(如铰链区、疏水后袋、核糖体结合区)为开发选择性抑制剂提供了差异化空间。伊马替尼针对BCR-ABL融合蛋白的酪氨酸激酶活性,开创了激酶靶向治疗的新纪元;吉非替尼选择性抑制EGFR激酶域,使非小细胞肺癌的精准治疗成为现实;而第三代ALK抑制剂劳拉替尼则通过优化与激酶后袋的相互作用,克服了多种耐药突变。爱思益普的激酶靶点筛选平台覆盖受体酪氨酸激酶、胞质酪氨酸激酶、丝氨酸/苏氨酸激酶及脂激酶四大类,能够对客户的候选化合物进行系统的靶点谱系分析。
酶学靶点筛选:从生化活性到细胞功能
爱思益普建立了完善的酶学检测平台,采用多种技术路线满足不同阶段的筛选需求。在生化水平,通过放射性标记(³³P-ATP)或荧光共振能量转移(FRET)方法检测激酶对合成肽底物的磷酸化效率,计算半数抑制浓度(IC50)和抑制常数(Ki)。对于结构已知的激酶,平台采用LC-MS/MS质谱技术直接检测磷酸化产物,无需放射性标记,灵敏度高且特异性强。在结合水平,表面等离子共振(SPR)技术实时监测化合物与激酶的结合动力学,提供结合速率(kon)、解离速率(koff)和亲和力(KD)等参数,有助于区分竞争性抑制剂与变构抑制剂。
然而,生化水平的酶活性抑制并不能完全等同于细胞内的药效学效应。化合物可能因细胞膜通透性不足、细胞内ATP浓度竞争或主动外排机制而无法达到有效靶点浓度。为此,爱思益普建立了从生化到细胞的功能验证体系。BaF3细胞是一种IL-3依赖的前B淋巴细胞系,通过转染特定激酶(如BCR-ABL、FLT3-ITD、EGFR T790M等)使其获得IL-3非依赖性增殖能力。当激酶抑制剂有效阻断下游信号时,细胞增殖被抑制,通过MTT或CTG法检测细胞活力,即可评估化合物在细胞环境中的靶点 occupancy。这一体系的优势在于:背景信号低(亲本BaF3细胞在IL-3撤除后迅速凋亡)、可扩展性强(几乎所有具有转化能力的激酶均可构建稳定细胞系)、与临床相关性高(直接反映激酶驱动的细胞增殖表型)。
激酶谱筛选:从选择性评价到脱靶风险管控
激酶选择性是新药研发中不可忽视的关键属性。临床前研究显示,许多激酶抑制剂因脱靶抑制其他激酶而产生剂量限制性毒性。例如,早期多靶点酪氨酸激酶抑制剂舒尼替尼因抑制VEGFR、PDGFR和KIT等多个靶点,导致高血压、手足综合征等不良反应;而选择性更高的阿昔替尼则显著改善了耐受性。因此,在候选化合物优化阶段,必须进行系统的激酶谱筛选,以明确药物的选择性谱系和潜在脱靶风险。
爱思益普的激酶谱筛选服务整合了多种检测技术,覆盖超过300种激酶靶点。筛选方案根据客户需求灵活定制:对于早期先导化合物,采用"激酶面板"(Kinase Panel)快速扫描,通常在20-50个代表性激酶中评估选择性,成本较低且周期短;对于进入候选化合物提名(PCC)阶段的分子,则扩展至全谱系筛选(Full Panel),甚至包含临床相关的突变体(如EGFR T790M、C797S、BRAF V600E、ALK G1202R等)。筛选数据以热图、网络图和IC50表格形式呈现,帮助客户直观识别选择性窗口和潜在脱靶风险。此外,平台还提供选择性指数(Selectivity Index)计算,即化合物对靶点激酶的IC50与对脱靶激酶IC50的比值,比值越高表明选择性越好。
从DMTA到临床转化:一体化激酶药物发现服务
爱思益普围绕创新药研发的DMTA(Design, Make, Test, Analyze)循环,构建了激酶药物发现的一体化服务体系。在Design阶段,基于靶点激酶的结构信息和已知抑制剂构效关系(SAR),通过分子对接和药效团模型进行虚拟筛选,缩小化学空间;在Make阶段,与化学合成团队紧密协作,通过快速平行合成(parallel synthesis)制备化合物库;在Test阶段,运用上述酶学、细胞和激酶谱平台进行多维度活性评价;在Analyze阶段,通过SAR分析和机器学习模型,预测下一轮化合物的优化方向。
这一闭环体系的效率已在多个合作项目中得到验证。例如,在某BTK抑制剂项目中,团队通过激酶谱筛选发现早期化合物对EGFR存在较强脱靶抑制,经分子模拟分析确定是化合物中的苯胺基团与EGFR的铰链区形成额外氢键。通过结构改造将苯胺替换为吡啶环,在保持BTK活性的同时,EGFR选择性提升了超过100倍。类似地,在某CDK4/6抑制剂项目中,BaF3细胞检测揭示化合物对CDK2也存在交叉抑制,可能导致骨髓抑制毒性。通过增加环状结构的空间位阻,成功实现了CDK4/6相对于CDK2的亚型选择性,最终化合物进入临床前开发阶段。
激酶药物发现领域正处于技术变革的交汇点。变构抑制剂、共价抑制剂、蛋白降解靶向嵌合体(PROTAC)等新型作用模式不断涌现,为传统"不可成药"靶点(如KRAS、SHP2)打开了新的窗口。爱思益普紧跟技术前沿,已将PROTAC降解效率检测和分子胶筛选整合至激酶服务平台,为客户提供从抑制到降解的多元化技术选择。未来,随着单细胞测序和空间转录组技术的发展,激酶信号网络的异质性将被更精细地解析,为开发更精准的激酶靶向药物提供新的靶点与策略。
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