广东
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近日，广东省农科院果树所在Horticulture Research期刊上发表题为“The pangenome enhances the understanding of the genetic diversity of papaya”的研究成果。果树所杨敏副研究员、周陈平副研究员为论文共同第一作者，杨敏副研究员和魏岳荣研究员为论文共同通讯作者。
该研究通过整合多个番木瓜资源基因组构建泛基因组，重点开展四方面研究：（1）构建同源基因、图形、线性三种泛基因组并比较，互补揭示番木瓜基因组变异全景，发现非核心基因与品种抗性、风味相关；（2）挖掘到T3品种RRG基因内含子区94 bp缺失变异，首次在番木瓜中揭示该基因通过调控根分生组织细胞增殖与伸长影响根长的分子机制；（3）利用222份种质重测序数据鉴定26173个高可信结构变异（SV），发现其可揭示SNP分析未捕捉的遗传关系，鉴定出驯化相关候选基因；（4）新增3个关键番木瓜品种（贮丰、T3和T5）及重新组装的紫晖品种高质量基因组，丰富了番木瓜基因组资源。
泛基因组分析鉴定到的功能基因结构变异（SVs）
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