公元643年，李世民痛哭流涕地对侯君集说：朕不想定你的罪！！

公元643年，李世民痛哭流涕地说：“你本有安邦定国之功，朕实在不想定你的罪！然众臣群谏，此罪天地不容，朕也没办法啊！”侯君集当即跪下，对李世民说：“罪臣死不足惜，但有一事请陛下成全！”
李世民经历玄武门之变后，封了五个一等公功臣，分别是长孙无忌，杜如晦，房玄龄，尉迟敬德，以及侯君集。
但值得一品的是，其他四个人都有详细的功劳记载，每个人都有拿的出让人信服的东西，唯独史书对侯君集这一趴记载不详，只是在《新唐书》上隐约提了一嘴：预诛隐太子尤力。
就是一笔带过他功劳很大，但大到什么程度，干了什么只有当事人知道了。

侯君集是陕西旬邑人，《旧唐书》里说他"性矫饰，好矜夸"，翻译成现代话就是爱显摆、会装。
这种性格有利有弊，得看碰见一个什么样的领导，再一个有没有一个适合他的机会。遇到李世民也是他的造化，可惜他不止一次想要谋反，最后葬送了自己。
司马光在《资治通鉴》里说他"性矫饰，好矜夸，玩弓矢而不能成其艺，乃以武勇自称"，司马光言外之意就是说他没什么本事，都是自吹自擂出来的。因为他小时候想要学箭法，怎么学也学不会，就干脆不学了，然后对外说自己勇武。
但现代史学家黄永年先生有不同的看法，他在《唐代政治史述论稿》里说："侯君集之才，实为唐初诸将中之佼佼者。"认为他的军事才能确实很突出。
从李世民对他的态度上来看，侯君集应该是有点本领在，只是可惜没有完全被记载下来。玄武门之变侯君集立了大功，这一仗打完，他就成了李世民的心腹。
李世民当上皇帝后，侯君集的仕途就跟开了挂似的。从一个小小的左卫将军，一路升到兵部尚书，最后还当上了宰相。
这期间他确实也干了不少实事，特别是在军事方面。比如平定吐谷浑的时候，他带着大军翻越祁连山，在高原上跟敌人周旋，最后大获全胜。这一仗打得漂亮，连李世民都夸他"智勇兼备"。

但人一得意就容易忘形。侯君集当上宰相后，开始有点飘了。他觉得自己功劳这么大，应该得到更多。特别是看到房玄龄、杜如晦这些人比他受宠，心里就更不平衡了。
贞观十三年（639年），高昌王断了西域和中原的商业往来，李世民不高兴，就让高昌王面见解释一下原因，谁知高昌王称病不来。这明显的挑衅且心怀鬼胎，李世民就派侯君集去攻打高昌国。
高昌王根本没当回事，他认为唐朝距离高昌有七千多里，中间还有2000里沙漠，不出二十天，侯君集就会因为粮草不够出问题，到时候高昌可趁机一举击败。
他想得美，可等侯君集到的时候，他却死了。有人劝说侯君集趁高昌国内奔丧，咱们搞偷袭。
侯君集拒绝了，并让人一路敲锣打鼓的弄声势，他觉得偷袭不是问罪之师，想要堂堂正正的打这个仗。高昌新王拒绝投降，侯君集软硬兼施用过后，就地开始制作木工机械设备，向城里投石。
这一仗他打得相当漂亮，几个回合，就把高昌逼得穷途末路，他收缴了大量战利品。
本来挺好的事，回去等着论功行赏就是了，结果他这会起了贪心。他匿了高昌的金银珠宝不说，还没等跟李世民汇报就私自把无罪的人流放了，这是要造反的节奏，放现代叫越权，放古代也该杀头了。
士兵们一看老大都开始捞钱，他们还矜持个啥，都开始捞，侯君集自己不干净根本不敢管。这事一来二去的就传到了皇帝耳朵里，侯君集就被抓起来了。
有大臣说这时候对功臣问罪，会寒了将士的心，李世民也就给他放了出来。
侯君集反而因此记恨李世民，觉得我拿命换的战功，拿你点钱咋了。
后来，张亮和侯君集聊天，侯君集依旧抱怨自己明明有功劳回去还要被关，这不就是皇帝排挤自己么？他越想越气，觉得老皇帝霸凌自己，这实在不能忍，拍着张亮大腿怒喝道：你造反不？你要是造反你记得告诉我一声，我跟你一起。
张亮一听，这扯啥呢。我跟你聊闲天，你跟我往死路上走啊。

张亮就告诉李世民了。李世民对侯君集相当宽容，他没怪罪侯君集，反而对张亮说：你俩的私房话，点到为止就得了。他对你说也是信任你。再说，也没有证人，他不承认，谁能证明。

此事作罢，又发生了李靖的事。侯君集非要和李靖学兵法，李靖教完，他就给李靖举报了。他说李靖有所保留肯定是要造反。李世民很生气，把李靖叫过来问话。
李靖很诚恳，他说：我教他的东西够他现在用了。可他不知足，非要学全部，若不是他要造反，实在解释不通，他为何要这样。
事实证明，李靖说对了。
太子李承乾总担心自己的太子之位不保，侯君集的女婿又在他门下效力，因此李承乾就和侯君集联系上了，俩人嘁嘁喳喳的密谋造反。
太子糊涂，侯君集也不聪明，事情败露，李世民气得要命。据《资治通鉴》记载，李世民在审问侯君集时还哭了，说："吾不欲令刀笔吏辱公，故自鞫验耳。"意思是我不想让那些小官审你，所以亲自来审。可见李世民对他还是有感情的。
临死前，他还请求李世民饶了他老婆孩子。李世民还算念旧情，只杀了他一个人，家人没受牵连。后来在凌烟阁二十四功臣里，侯君集还是榜上有名，只不过排名比较靠后。