上海
胶质瘤是中枢神经系统中最具侵袭性和异质性的肿瘤之一，其高度的细胞状态多样性和复杂的免疫微环境是导致治疗失败和预后不良的重要原因。近年来，单细胞 RNA 测序技术在解析胶质瘤的细胞组成和转录异质性方面取得了重要进展，但现有研究主要聚焦于 基因表达水平 ，而对 RNA 可变剪切（ alternative splicing, AS ）这一关键转录后调控层面 的系统性认识仍然十分有限 。
近日， Genome Biology 杂志上发表了题为
A single-cell atlas of RNA alternative splicing in the glioma-immune ecosystem的研究，在本研究中，我们利用高覆盖度的单细胞RNA测序数据（ SMART-Seq2 ），构建了一个覆盖肿瘤细胞及肿瘤免疫微环境的胶质瘤免疫生态系统中RNA可变剪切的单细胞图谱。通过系统分析外显子使用、剪接事件和转录本结构，我们揭示了胶质瘤中不同肿瘤细胞状态（如间质样、神经前体样等）以及多种免疫细胞类型在可变剪切层面的显著差异
研究发现， RNA 可变剪切与胶质瘤细胞状态转换、肿瘤异质性以及治疗响应密切相关。我们鉴定出多种具有细胞状态特异性的剪接事件及其调控因子，这些剪接改变不仅影响关键转录调控网络，还可能参与放疗耐受、免疫逃逸等肿瘤进展过程。同时，肿瘤浸润免疫细胞也表现出特异性的剪接调控特征，提示可变剪切在塑造肿瘤免疫微环境中发挥重要作用 。
总体而言，本研究从 单细胞和剪接异构体层面 系统刻画了胶质瘤 - 免疫生态系统的分子特征，弥补了传统基因表达分析的不足。该图谱为理解胶质瘤细胞状态可塑性、肿瘤 - 免疫互作机制提供了新的视角，也为未来开发以剪接异构体为靶点的精准治疗和免疫治疗策略奠定了基础 。
原文链接：https://link.springer.com/article/10.1186/s13059-025-03889-9
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