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徐华栋/陈弓JACS:基于三唑环“分子捕鼠夹”设计的胺选择性生物偶联

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导读

生物分子的选择性修饰对推动现代生物医学发展至关重要。尽管在靶向高反应性但低丰度的巯基方面已取得显著进展,但针对其他天然官能团,尤其是广泛存在的氨基,开发高效、特异的修饰策略仍是一项迫切需求。因此,发展一种在反应效率与精准度上可媲美硫醇化学,并能与之严格正交的氨基标记新方法,将极大拓展生物分子的标记范围。近日,常州大学徐华栋教授与南开大学陈弓教授团队合作,开发了一类新型吡啶并三唑甲醛(PTAC)试剂。该试剂可在温和、生物相容的条件下,实现对小分子及复杂生物分子中伯烷基胺的高效、选择性且近乎无副反应的标记。PTAC的独特之处在于其“捕鼠夹”式(“snap-trapping”)的快速选择性捕获机制:其“诱饵”醛基首先与胺反应生成亚胺中间体,随后触发由互变异构介导的三唑环摆动,从而不可逆地捕获胺底物,并仅释放水作为唯一副产物。吡啶环与三唑结构的融合弱化了N-N键的稳定性,使其更易被胺选择性激活,同时确保了优异的稳定性及硫醇正交性。该策略兼具高反应活性、优异化学选择性及良好官能团耐受性,在胺特异性生物偶联中达到了硫醇级别的性能水平,为现有硫醇修饰方法提供了重要的替代和补充方案。


1,2,3-三唑作为叠氮-炔烃点击化学的核心骨架,已在分子偶联中被广泛确立为一种稳定且通用的连接子。然而,在此广泛应用背后,其自身所固有的开环-关环互变异构反应性却长期未被充分探索。尽管该过程传统上受限于苛刻的反应条件和有限的合成应用价值,但近年研究表明,通过对三唑衍生物进行合理修饰,能够在温和条件下有效利用这一反应性。其中,将三唑与吡啶环融合已被证实能显著增强其环-链互变异构倾向。受此启发,作者推测吡啶并三唑甲醛(PTAC)或许能通过一种“中断的L'abbé重排”机制,在温和条件下实现与伯胺的高选择性反应。


如图2所示,作者发现吡啶并三唑甲醛能够与各种烷基伯胺和芳胺反应,生成相应的吡啶基三唑,反应条件温和、产率高、体系干净,且能兼容各种官能团。同时,该反应对各种溶剂和添加剂具有显著的耐受性。比如在56度的白酒中,模板底物苄胺(4)与PTAC 1反应6 h,也可以高收率和非常干净的反应体系得到目标产物(4-1)。此外,该策略还能方便地改造含有伯胺的药物分子,在药物化学领域具有非常好的应用前景。


作者随后考察了该反应的多肽底物适用性。首先选取含赖氨酸(Lys)的模板三肽(26),与1.5 equiv的PTAC 1、2.0 equiv的DIPEA在DMSO中反应,2 h内即可定量转化获得目标产物(26-1)。反应后过量的PTAC 1可通过键合甘氨酸的酰胺树脂在室温下处理2 h并过滤,即可实现高效清除并获得高纯度的反应产物(LC trace 2)。如图3所示,该方法对不同氨基酸组成及链长的复杂多肽均表现出优异的适用性。值得注意的是,包括半胱氨酸(Cys)在内的所有蛋白源氨基酸均可兼容,并可与多种取代的PTAC衍生物实现高效、高选择性偶联。如环肽药物阿托西班(34)与PTAC 17反应可实现定量转化。二十三肽 Neuromedin U (rat)(38)与炔基化PTAC 39亦可定量转化为炔基标记产物(38-39)。此外,该策略还可通过一锅两步法,高效、便捷地对复杂肽上的Lys和Cys残基进行双位点标记。如GP(33–41)(45)与PTAC 17反应2 h后,随后加入马来酰亚胺-PEG2-生物素(46),即可以90%的LC收率得到双标记产物(47)。


如图4所示,在优化条件下,该策略可广泛应用于蛋白质、抗体及DNA等生物大分子的伯胺修饰。例如,含10个Lys残基的核糖核酸酶A(49)与生物素化PTAC 37反应后,成功实现了1至7个赖氨酸位点的标记(49-37n)。同样,该方法也适用于曲妥珠单抗(52)的炔基化标记(52-39n)。对于常用于DNA编码化合物库合成的DNA headpiece(53),也可与带有荧光基团的PTAC 51反应,以90%的转化率得到偶联产物(53-51)。


这一成果最近发表在J. Am. Chem. Soc.上,常州大学徐华栋教授和南开大学陈弓教授为通讯作者,初鑫博士和博士生钟惠敏、硕士生金鹏和魏成成为该工作的顺利进行做出了重要贡献。https://doi.org/10.1021/jacs.5c15886

徐华栋教授简介:

徐华栋,常州大学药学院教授。2007年于伊利诺伊大学芝加哥分校(UIC)取得博士学位,2007年至2009年在美国威斯康辛大学麦迪逊分校药学院博士后工作,2010-2012年华东师范大学副研究员,2012年5月起就职于常州大学。

陈弓教授简介:

陈弓,南开大学化学学院教授。国家杰出青年基金获得者,科技部领军人才,英国皇家化学会会士(FRSC),

Organic Letters
杂志执行主编。1998年毕业于南京大学化学系,2004年在美国哥伦比亚大学化学系获博士学位,2005-2008年在美国纪念斯隆-凯特琳癌症中心从事博士后研究。2008年起任美国宾夕法尼亚州立大学化学系助理教授,2014年晋升为终身副教授。2015年起,在南开大学元素有机化学全国重点实验室全职工作。

We turned a triazole ring into a snap-trapping device to capture amino groups for bioconjugation. It is super reactive and selective. Thiols are spared. Fruitful collaboration with Huadong Xu at Changzhou University.

We turned a triazole ring into a molecular mousetrap—snapping up amino groups for bioconjugation!
Super reactive, highly selective, and thiol-tolerant.
Great teamwork with Huadong Xu (Changzhou University)!


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