当你满怀期待地开展空间转录组实验,是否也曾遇到这些困扰:
想捕捉肿瘤微环境中的细胞互动,却因分辨率不足而错过关键的低丰度细胞
手握珍贵样本,却因技术不匹配,眼睁睁看着它们变成「数据孤岛」
实验设计早已规划,却因设备昂贵、流程复杂而迟迟难以落地
而以 Slide-seq 和 Slide-tags 为代表的 Nature、Science 级别技术,正推动空间转录组学向前迈进以应对这些挑战 ——无需专用空间组学设备,即可实现近乎单细胞级别的高分辨率,并具备广泛的真核生物物种兼容性。
Slide-seq、Slide-tags 技术原理
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那么,在现实的科研场景中,我们该如何突破技术壁垒,高效开启高质量的空间生物学研究?宝日医将于2025 年 11 月 20 日(周四)14:00,推出专题讲座《从技术原理到数据分析,全面拆解单细胞空间转录组学》。本次直播将直面当前空间转录组研究中的典型痛点,分享无需专用设备即可实现高分辨率的灵活解决方案—— 基于 Slide-seq 与 Slide-tags 两大前沿技术衍生的 Seeker 与 Trekker 深度解析。现在报名直播,还有机会赢取乐扣保温杯、熊猫抱枕被、计时器、洗漱化妆包、数据线、帆布包等多重精美礼品!
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直播亮点抢先看:
空间转录组学技术前沿与 Takara 双技术路线解析
从瓶颈到破局:空间转录组技术怎么选?分辨率与适用场景深度解析
方案核心揭秘:深度剖析 Takara Seeker 与 Trekker 双技术路线的原理、独特优势与适用场景。
案例解读:单细胞分辨率空间组学方案的应用实战与案例分享
小贴士:Seeker 与 Trekker 技术路线
Seeker Spatial Transcriptomics Kit
无需 NGS 以外的专用设备和探针,也无需具备显微操作专业知识
以含有 polyA 的全转录组为对象进行 NGS 分析,支持人、鼠以外的真核生物
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Trekker Single-Cell Spatial Mapping Kit
真正单细胞分辨率:无需解卷积、无需分割,更无需复杂算法
通过 DNA 条形码标记细胞核,无需分割即可进行准确的空间分析
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内容策划:沈佳钰
内容审核:朱卿
题图来源:图虫创意
参考文献
[1].Rodriques SG, Stickels RR, Goeva A, et al. Slide-seq: A scalable technology for measuring genome-wide expression at high spatial resolution. Science. 2019 Mar 29;363(6434):1463-1467. doi: 10.1126/science.aaw1219.
[2].Stickels RR, Murray E, Kumar P, et al. Highly sensitive spatial transcriptomics at near-cellular resolution with Slide-seqV2. Nat Biotechnol. 2021;39(3):313-319. doi:10.1038/s41587-020-0739-1
[3].You Y, Fu Y, Li L, et al. Systematic comparison of sequencing-based spatial transcriptomic methods. Nat Methods. 2024;21(9):1743-1754. doi:10.1038/s41592-024-02325-3
[4].Russell AJC, Weir JA, Nadaf NM, et al. Slide-tags enables single-nucleus barcoding for multimodal spatial genomics. Nature. 2024 Jan;625(7993):101-109. doi: 10.1038/s41586-023-06837-4.
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