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人类基因组变化速度远超以往认知,迄今最全面跨代遗传变化图谱绘成

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了解人类DNA如何在世代间变异,对于评估遗传疾病风险、理解人类的进化过程至关重要。但直到现在,研究人员一直难以涉足人类DNA中一些变异最频繁的区域。

美国犹他大学、华盛顿大学、太平洋生物科学公司等机构的研究人员利用多种DNA测序技术,绘制出迄今最全面的世代遗传变异图谱。这项新研究显示,部分人类基因组的变异速度比以前认为的快得多,这为深入了解人类的疾病根源和进化历程奠定了基础。4月23日,相关论文发表于《自然》。

“正是突变最终使我们有别于其他物种。”论文作者之一、犹他大学斯宾塞·福克斯·埃克尔斯医学院的Lynn Jorde表示,“我们正在探寻人类一个非常基本的属性。”

通过对比父母和子女的基因组,研究人员可以检测出新突变发生并遗传的频率。Jorde解释说,这种频率对于理解人类生物学的重要性,就像光速对于理解物理学一样。

“我们看到的个体之间的所有遗传变异都是这些突变的结果。”Jorde说。随着时间的推移,这些变异造成了从眼睛的颜色到消化乳糖的能力,再到罕见遗传疾病等方方面面的不同。

研究人员估计,每个人都有近200个不同于父母的新遗传变异。其中许多变异发生在特别难以研究的DNA区域。

论文作者之一、犹他大学斯宾塞·福克斯·埃克尔斯医学院的Aaron Quinlan表示,以前的研究仅限于基因组中变异最少的部分,但这项研究采用了先进的测序技术,揭示了人类DNA中变异最快且“以前无法触及的”区域。

“我们发现人类基因组某些部分的变异速度快得惊人,几乎每一代都会发生一次突变。而其他的DNA片段则更稳定。”Quinlan说。

Jorde认为,研究结果可为遗传咨询提供重要支持,帮助回答这类问题——“如果有一个患有某种疾病的孩子,该病可能是从父母那里遗传的,还是一个新突变导致的?”

由“突变热点”区域的变异引起的疾病更有可能是孩子独有的,而不是从父母那里遗传的。这意味着父母生育其他患有同样疾病的孩子的风险较低。但如果是从父母那里遗传的,这些父母未来的孩子患这种疾病的风险更高。

新发现与一个犹他州家庭有关。自上世纪80年代以来,这个家庭一直作为人类多态性研究中心联盟的一部分,与遗传学家合作,为人类基因组计划提供了极为宝贵的帮助。该家庭四代人都捐赠了DNA,并同意对其进行分析。这使遗传学家能够极其深入地研究新变异是如何产生的,以及如何从父母遗传给子女。

“拥有如此广度和深度的大家庭是一种非常独特、宝贵的资源。”论文作者之一、犹他大学斯宾塞·福克斯·埃克尔斯医学院的Deborah Neklason说,“它帮助我们细致了解了基因组在世代间的变异。”

为了获得关于遗传变异随时间变化的完整、高分辨率图谱,研究团队利用多种不同技术对每个人的DNA进行了测序。有些技术最适合检测DNA可能发生的最小变化;有些技术则可以一次扫描大片段DNA,以发现较大变化,并观察基因组中其他难以测序的部分。由此,研究人员实现了两全其美——在小尺度和大尺度上都达到了准确性。

在未来的工作中,研究人员希望将全面测序技术扩展到更多人身上,以了解不同家庭的遗传变异速度是否不同。“下一个问题是,当试图预测疾病风险或基因组如何进化时,这些发现能在多大程度上适用于不同的家庭?”Quinlan说。

测序结果将免费公开,以便其他研究人员在自己的工作中使用这些数据,从而为进一步了解人类进化和遗传疾病打开大门。

来源:中国科学报

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