01
从“抑制”到“降解”
PROTAC技术即将取得正果
2025年6月,靶向蛋白降解(Targeted Protein Degradation, TPD)领域迎来关键性时刻。由 Arvinas 与辉瑞联合开发的口服降解剂 Vepdegestrant(ARV-471) 正式向FDA 提交新药上市申请(NDA),用于治疗 ESR1 突变的 ER阳性/HER2阴性(ER+/HER2-)晚期或转移性乳腺癌患者。这一里程碑的意义,不仅在于它可能成为全球第一个获得监管批准的 PROTAC 药物,更在于它验证了 TPD 技术在复杂临床适应症中的可行性,标志着降解疗法登堂入室、取得正果的第一步。
图1. Vepdegestrant化学结构。
从分子结构看(图1),Vepdegestrant 是一个典型的双功能 PROTAC 嵌合体,明确分为三个关键模块:
红色区域:E3泛素连接酶招募模块(Recruiting Module)
该部分负责特异性结合细胞内的 E3 泛素连接酶 cereblon(CRBN),将降解机器引入反应复合体中。其功能并非直接作用于目标蛋白,而是充当“引荐者,即将目标蛋白引导进入细胞自身的蛋白降解系统(图2)。
蓝色区域:靶向模块(Targeting Ligand)
该部分专一识别并结合雌激素受体(ER),是整个 PROTAC 分子的“定位系统”。通过高亲和力锁定 ER,使其成为被降解的目标蛋白(POI),为后续的泛素化反应奠定基础(图2)。
绿色区域:连接子(Linker)
连接子将 ER 配体与 CRBN 配体串联在一起,起到空间架桥作用。它的长度与柔性必须恰到好处,以便促进三元复合物的构建,使目标蛋白与 CRBN 在空间上充分靠近,触发泛素化与后续降解(图2)。
图2. Vepdegestrant作用机制示意图。(图片来源:Expert Opinion on Pharmacotherapy)
Vepdegestrant 的降解机制区别于传统抗雌激素药物如他莫昔芬(Tamoxifen)或氟维司群(Fulvestrant),后者只是竞争性拮抗 ER 功能,而 PROTAC 分子通过诱导 ER 蛋白泛素化并进入蛋白酶体,实现“清除”而非“抑制”。这种机制在应对 ESR1 突变所引发的激素治疗耐药中展现出特殊优势。
Vepdegestrant的新药申请基于 III 期临床试验 VERITAC-2 的数据。研究纳入 624 例接受过 CDK4/6 抑制剂与内分泌治疗的 ER+/HER2- 晚期乳腺癌患者,并在其中重点分析了 43% ESR1 突变阳性亚组。结果显示,Vepdegestrant 在该人群中的无进展生存期(PFS)显著优于标准治疗 氟维司群。这一成果不仅在 2025 年 ASCO 年会中发布,还发表于《新英格兰医学杂志》,并入选 ASCO“Best of”推荐,代表其在临床与学术界获得的双重认可。
Vepdegestrant 的意义远不止于某一靶点或适应症的推进。作为 TPD 概念的首个临床转化代表,它验证了 PROTAC 药物在真实世界肿瘤治疗中的药效潜力,也开启了未来更多“不可成药靶点”被“靶 向清除”的现实通道。
02
不止是PROTAC
靶向降解技术迈入多模态时代
Vepdegestrant 的上市申请不仅象征着 PROTAC 概念的临床化突破,也在事实上揭示了靶向蛋白降解(TPD)技术的一条核心演化路径:从“连接 E3 和目标蛋白”的单一策略,走向围绕“诱导降解”这一目标的多模态、多路径拓展。
过去两年,研究者不再局限于传统 PROTAC 所依赖的蛋白酶体/E3连接酶体系,而是开始探索更多“降解通道”的可能性,涵盖溶酶体、自噬体、内吞受体,甚至病毒相关机制。这些新的降解策略被统称为 “XX-TACs”(Targeting Chimeras),不仅极大地拓宽了靶点空间,也丰富了分子形式与给药方式,进一步推动了“不可成药蛋白”领域的药物发现。
2.1 PolyTACs:重构内吞通路,靶向难成药膜蛋白
在靶向蛋白降解技术中,大多数传统策略(如PROTAC)依赖细胞内蛋白酶体系统,仅适用于胞内蛋白。而对于细胞膜蛋白或分泌型胞外蛋白,由于它们位于细胞膜外侧或细胞外空间,PROTAC 无法触及,因此长期被视为“不可成药”靶点。
为解决这一难题,研究者提出了LYTAC(Lysosome-Targeting Chimera,溶酶体靶向嵌合体)技术。LYTAC 通过招募细胞表面的天然转运受体(如 ASGPR、CI-M6PR),将膜蛋白或胞外蛋白内吞入胞,并引导其进入溶酶体中降解。该机制开辟了面向胞外靶点的靶向降解新路径,但其局限在于对特定受体的高度依赖,导致适用范围受限(如 ASGPR 主要表达于肝组织)。
PolyTAC(Polymeric Lysosome-Targeting Chimera)技术的出现,正是对这一瓶颈的突破。PolyTAC 可视为一种“非受体依赖型 LYTAC”,通过人工设计的聚合物支架,将目标膜蛋白与特定“辅助蛋白”配体同时结合,在细胞膜表面形成多价复合物,诱导内吞并导入溶酶体降解。其作用机制如图3所示。
图3. PolyTACs作用机理示意图。(图片来源:bioRxiv)
·抗体片段(深蓝色Y 形):特异性识别目标膜蛋白(POI,黄色),如 PD-L1、EGFR、HER2 等;
·聚合物主链(绿色链条):作为支架结构,连接多个功能单元;
·小分子配体:与细胞膜上的“辅助蛋白”(Helper protein,紫色)结合,触发内吞作用。
当PolyTAC 同时结合目标蛋白与辅助蛋白后,会在膜表形成多位点聚集(multisite binding),触发细胞启动受体介导的内吞机制。整个复合体被内吞进入细胞,最终送入溶酶体中完成降解。
这种机制打破了对天然转运机制的依赖,具有更强的组织适配性与降解普适性;利用“AND逻辑”控制降解门槛,提升靶向性;支持双靶点协同降解与模块化结构替换;有望广泛应用于免疫肿瘤、难成药膜蛋白调控等领域。
2.2 VIPER-TACs:利用病毒“自毁武器”精准杀伤癌细胞
要想让一个细胞失去生存能力,最有效的办法之一,就是让它体内的关键蛋白(essential protein)彻底消失。传统的靶向药物往往只是抑制这些蛋白的功能,而不能将它们彻底清除。靶向蛋白降解(TPD)技术则不同,它直接让蛋白在体内“被回收、被处理”,真正意义上实现功能清零。
在PROTAC之外,新兴的VIPER-TACs (Viral E3 Pan-Essential Removing TACs)技术利用了一种精准的定位技术,让病毒的蛋白降解机制反过来为人类服务。
VIPER-TACs核心设计是利用人乳头瘤病毒(HPV)中的一种蛋白vE3(viral E3 ligase,亦称E6),它是一种病毒自带的 E3 连接酶,天然能够降解多种人体蛋白。研究人员正是利用vE3这一能力,实现选择性地降解癌细胞中的关键蛋白。
VIPER-TACs的作用机制如图4所示:
图4. VIPER-TAC作用机制示意图。(图片来源:Cell Chemical Biology)
图4可以分为上下两部分,分别对应正常细胞与病毒感染细胞对VIPER-TAC 的反应差异:
·正常细胞(图4上):
在正常细胞中,VIPER-TAC 分子虽然可以与目标蛋白结合,但由于缺乏病毒特有的 E3 连接酶 vE3),无法启动降解过程,所以目标蛋白得以保留,细胞正常生存,无毒副作用。
·病毒感染细胞(图4下):
当细胞被病毒感染(如HPV)时,病毒蛋白 vE3得以表达;VIPER-TAC 一端结合目标蛋白,一端通过vE3与病毒 E3 蛋白结合,从而构建起一个“病毒酶+目标蛋白+降解分子”的三元复合物,启动泛素化。最终,关键蛋白被送入蛋白酶体清除,感染细胞因关键功能丧失而死亡。
这一机制的最大亮点是选择性极高,即只有在“携带病毒”的细胞中,VIPER-TAC 才能真正启动降解机制。因此,它尤其适合用来治疗HPV 阳性的癌症,如部分宫颈癌和头颈癌。相比化疗或靶向抑制剂,这种方式能够做到精准杀伤病毒感染细胞、最大限度保留正常组织、打击难以抑制的“核心依赖蛋白”,提升抗肿瘤效率。
2.3 ByeTACs:让蛋白酶体“直通目标”的极简降解设计
靶向蛋白降解技术的主流范式,如PROTAC,往往需要组装一个“三元复合体”:目标蛋白、PROTAC、E3 泛素连接酶。组装之后,E3 把泛素贴到目标蛋白上,蛋白酶体再接手完成清除。看似高效,但这个过程实则高度依赖于合适的 E3 酶“上线服务”。
问题是,人类细胞中虽存在数百种 E3 酶,但它们的表达具有组织特异性,且可利用的泛素连接酶种类十分有限,这成了 TPD 技术进一步推广的一道“瓶颈”。ByeTACs(Bypassing E3 Ligase for Proteasomal Degradation) 技术的开发,正是为了解决这个问题:既然招募 E3 太复杂,为什么不直接把目标蛋白送进蛋白酶体?
图5展示了ByeTAC 分子如何直接连接目标蛋白(POI)与蛋白酶体上的“接收点”Rpn13。
图5. ByeTAC作用机制示意图。(图片来源:J. Med. Chem.)
·ByeTAC蓝色结构域是一个专门设计用于结合 Rpn13 的小分子配体。Rpn13 是 26S 蛋白酶体上的识别亚基;
·ByeTAC黑色结构与是一个柔性 linker,用于调节空间构象;
·ByeTAC粉色结构域是与目标蛋白(POI)结合的小分子配体;
最终复合物形成后,整个目标蛋白就被“拉进”蛋白酶体,不需泛素标签也能被降解。
ByeTAC技术平台的优势在于无需 E3 酶,简化分子设计;不需要泛素标记,理论上更快、更直接、更高效;特别适合在肿瘤、神经退行性疾病等 E3 酶表达缺陷的场景下使用;结构紧凑,可成药性强:分子更小、更稳定,利于口服与组织穿透。
2.4 AUTOTACs:激活细胞“吃掉自己”的清道夫机制
细胞并不总是依赖蛋白酶体来处理蛋白质垃圾。面对更大、更难清除、或发生聚集的蛋白,细胞会启动一条更强力的通道:自噬系统(Autophagy )。 AUTOTAC ( Autophagy-Targeting Chimera )正是沿着这条通路展开的创新降解策略,它通过诱导自噬机制,让目标蛋白主动“被打包”并送入溶酶体,从而被彻底分解清除。其结构与作用机制如图6所示:
图6. ATUOTAC结构与作用机制示意图。(图片来源:Nature Communications)
构建AUTOTAC 分子
AUTOTAC 分子同样由三部分连接组成:
·TBL(Target-binding ligand):专门识别并结合目标蛋白;
·ATL(Autophagy-targeting ligand):结合细胞自噬受体
·两者通过linker连接,构成双功能嵌合体(Chimeric ligand)。
AUTOTAC作用机制
AUTOTAC将目标蛋白与p62 结合在一起。p62 被称为自噬系统中的“桥梁蛋白”,能够与 LC3 (Microtubule-associated protein 1A/1B-light chain 3)结合,引导整个复合体进入自噬流程。目标蛋白在此过程中被聚合、隔离,失活并准备“打包运输”。
当AUTOTAC 分子同时结合目标蛋白与 p62 后,就像贴上了“回收标签”。p62 本身是自噬系统的桥梁蛋白,它通过与 LC3 蛋白结合,将整个复合体引导至自噬小体膜上。这一步完成后,目标蛋白随即被打包进一个双层膜结构中,形成自噬体(autophagosome)。随后,自噬体与溶酶体融合,形成自噬溶酶体(autolysosome),其中包含的目标蛋白就会被各种水解酶彻底分解清除。值得一提的是,部分 AUTOTAC 分子本身可能不会被降解,有望实现持续降解作用。
这一机制的最大亮点在于不依赖泛素或蛋白酶体;特别适合聚集蛋白、膜蛋白等“难清除目标”;可激活细胞本身的“回收系统”,具有较强的生理兼容性。随着对 p62–LC3–自噬体这一链路的深入研究,AUTOTAC 为复杂适应症(如神经退行性疾病、肿瘤)提供了一种“细胞内自毁程序”式的解决方案。
03
结语与展望
从“成药性”走向“清除性”
TPD技术迈入全能时代
Vepdegestrant 的上市申请不仅为靶向蛋白降解(TPD)领域点亮了第一盏“监管绿灯”,更揭示出一个趋势日益明朗的未来:TPD 正在从一种新机制,演变为一个多路径、多通道、多适应症的药物开发平台。
过去,我们以是否“可成药”来评估靶点的开发潜力;而今天,TPD技术正以“是否可清除”作为新的判断标准,把那些曾经被认为“不可成药”的蛋白重新纳入药物化学视野。在这个转变过程中,我们见证了从PROTAC到ByeTAC, VIPER-TAC, AUTOTAC, PolyTAC的范式裂变,每一种新策略,都是对蛋白降解边界的拓展。
值得注意的是,这场“降解革命”的内核,并非简单的降解路径替换,而是一种更底层的药物开发逻辑转变:从功能拮抗,走向直接清除;从对蛋白功能的抑制,走向对蛋白本体的“处理”与“回收”。这将为诸多具有“成瘾性依赖”的癌症靶点、具有聚集特征的神经病变蛋白,乃至难以抑制的病毒关键蛋白,提供更加本质和彻底的解决方案。
未来,随着 TPD 技术的进一步发展,将有更多靶点从“难以成药”转向“可以降解”;将有更多病种,从传统靶向疗法的边缘,纳入 TPD 的新范式之中;将有更多原创新药,从单点构想,走向以机制为支撑、以降解为核心的系统性开发。
从“蛋白抑制”到“蛋白清除”,TPD 并非仅是机制创新,更是一次对疾病可治疗边界的重塑。而 Vepdegestrant,只是这场革命的开始。
附表: TAC技术对比
主要参考文献
Arvinas and Pfizer's Vepdegestrant Significantly Improves Progression-Free Survival for Patients with ESR1-Mutant, ER+/HER2- Advanced Breast Cancer. Pfizer Press Release. 31. 05. 2025.
Dutta, R. et al. Multivalent Ligand-Protein Interactions Using Polymeric Lysosome-Targeting Chimeras (PolyTACs) Leads to Lysosome-Targeting Receptor-Independent Degradation of Transmembrane Proteins. bioRxiv 2025.05.06.652519; doi: https://doi.org/10.1101/2025.05.06.652519
Mangano, K. et al.VIPER-TACs leverage viral E3 ligases for disease-specific targeted protein degradation. Cell Chemical Biology. (2025)32, 423 - 433.e9.
Loy, C. A. et al. ByeTAC: Bypassing E-Ligase-Targeting Chimeras for Direct Proteasome Degradation. J. Med. Chem. (2025)68, 9694-9705.
Ji, C.H.et al. The AUTOTAC chemical biology platform for targeted protein degradation via the autophagy-lysosome system. Nat Commun13, 904 (2022). https://doi.org/10.1038/s41467-022-28520-4
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