滴血测癌！血浆EB病毒DNA片段组学助力鼻咽癌早筛

EB 病毒是一种双链 DNA 病毒，属于疱疹病毒科，人群中的感染极为广泛。鼻咽癌与EB病毒密切相关，血浆中的癌源性 EBV DNA是一种有用的肿瘤标志物，可用于肿瘤的检测、诊断和监测。2025 年 3 月，香港中文大学卢煜明教授团队在《Cancer Cell》期刊上发表的研究论文《Fragmentomics profiling and quantification of plasma Epstein-Barr virus DNA enhance prediction of future nasopharyngeal carcinoma》，为鼻咽癌的早期预测开辟了新的道路 。

研究采用前瞻性队列研究方法，招募了 20174 名受试者，使用实时 PCR 检测血浆中的 EBV DNA 。第一轮筛查确认了 34 例鼻咽癌患者，初始招募后中位时间约 4 年时对其中 17838 人（排除第一轮已确诊的 34 例鼻咽癌病例）进行了第二轮筛查，新发现 24 例鼻咽癌患者。研究重点关注了第一轮血浆 EBV DNA 结果短暂阳性和持续阳性的受试者，并对这些受试者第一轮筛查保留下来的血液样本进行靶向 EBV 测序，深入分析血浆 EBV DNA 的分子特征，包括定量分析以及片段组学特征。

研究队列和受试者选择

在对血浆 EBV DNA 的片段大小分析中，研究团队有了关键发现。已有研究表明，鼻咽癌患者的血浆 EBV DNA 呈单核体大小模式，峰值频率约为 160bp，而无鼻咽癌的人群中不存在这种特征。研究进一步证实，在第二轮筛查中发现鼻咽癌的受试者，其第一轮血液样本的血浆 EBV DNA 具有单核小体大小模式。相比之下，未识别鼻咽癌受试者的血浆 EBV DNA 没有类似的大小分布模式。对片段大小差异进行分析，第二轮确诊鼻咽癌的 7 名受试者血液样本的 EBV DNA 大小比（中位数）显著低于短暂阳性、持续阳性的非鼻咽癌受试者样本。表明血浆 EBV DNA 的片段大小特征与鼻咽癌的发生密切相关，可作为预测鼻咽癌风险的重要指标 。

研究队列中血浆 EBV DNA的大小分析

研究团队对血浆 EBV DNA 的末端基序进行了探索性分析，发现鼻咽癌组和非鼻咽癌组之间的末端基序存在显著差异。在探索数据集中分析得出，8 个端基序（TT、AT、GT、TC、CT、TG、AA 和 TA）在鼻咽癌样本中显示出较高的比例，被归类为 “鼻咽癌富集端基序”；2 个末端基序（CC 和 GG）在鼻咽癌样本中的比例较低，被归类为 “鼻咽癌耗尽末端基序”。基于此，研究团队提出了一个指标 —— 鼻咽癌相关 EBV DNA 末端基序得分，将其定义为血浆 EBV DNA 中鼻咽癌富集末端基序比例与鼻咽癌缺乏末端基序比例的相对比率。通过将该评分应用于研究中的不同组，发现第二轮筛查识别的 7 名鼻咽癌受试者的鼻咽癌相关 EBV DNA 末端基序得分中位数显著高于非鼻咽癌受试者。

鼻咽癌和非鼻咽癌患者血浆 EB病毒DNA末端序列分析

研究队列中血浆 EBV DNA的末端基序分析

研究利用 FRAGMA ，发现在鼻咽癌患者中血浆 EBV DNA 高甲基化 CpG 位点的 CGN/NCG 基序比率显著高于低甲基化 CpG 位点的基序比率 。表明分析 CGN 和 NCG 基序比率可用于推断血浆 EBV DNA 的甲基化状态。进一步分析显示，当前队列中第二轮筛查的 7 例鼻咽癌患者血浆 EBV DNA 调整后的中位数 CGN/NCG 基序比值显著高于暂时阳性或持续阳性非鼻咽癌受试者。在第二轮发现鼻咽癌患者的第一轮血液样本中，血浆 EBV DNA 的高调整的 CGN/NCG 基序比率表明，他们的甲基化谱与已建立的鼻咽癌患者相似 。

进一步将血浆 EBV DNA 的含量、片段大小、末端基序和 FRAGMA 多指标进行联合分析，将四指标同时达标的视为 NPC 高危人群。结果表明，此联合分析可精准筛选出患癌风险高于普通人（EBV DNA 阴性人群）87.1 倍的高风险人群，其风险预测能力远远优于目前任何一个单一指标 。

血浆 EBV DNA的基于片段化的甲基化分析(FRAGMA)

本研究为鼻咽癌的早期筛查和风险预测提供了全新的策略，有望极大地提高鼻咽癌的早期诊断率，减少不必要的侵入性检查，为患者带来更好的治疗前景 。

鼻咽癌筛查是片段组学技术在癌症早筛领域的一个成功范例，其未来的应用前景更为广阔。理论上讲，几乎所有由病毒感染引发的癌症，都有可能借助类似的片段组学分析技术实现更精准的早期筛查 。比如与乙肝病毒（HBV）相关的肝癌、人乳头瘤病毒（HPV）相关的宫颈癌等。这些病毒在感染人体并诱导细胞癌变的过程中，其 DNA 或与病毒相关的宿主细胞 DNA 片段，极有可能呈现出类似于 EBV DNA 在鼻咽癌中的独特片段组学特征。通过深入研究这些特征，有望开发出针对不同病毒相关性癌症的早期筛查方法。