一次性解锁N种高端大气上档次的韦恩图及UpSet图的绘制方法

韦恩图是一种关系型图表，通过图形之间的重叠来反映数据集之间的相交关系。对于数据集之间交叠关系的可视化，通常想到的是绘制韦恩图。

本期内容就为大家分享绘制韦恩图的多种方法。

01Origin绘制韦恩图

在使用Origin绘制韦恩图之前，我们首先需要下载Venn Diagram的App，下载方法如下：

打开Origin软件，点击“帮助 -> Origin支持和资源”进入Origin官网；

点击“Log In”登陆自己的账户，没有账号的小伙伴可以免费注册（不需要教育邮箱）。

登陆后回到Origin官网首页，找到“Apps”；

在这里可以找到“Venn Diagram”，点击“Download File”下载文件；

下载完成后，将下载好的“VennDiagram.opx”文件拖拽到Origin的Apps窗口中即可。

下面我们将数据导入至Origin中，这里我们就随便输入一些数据，选中数据；点击Apps窗口的Venn Diagram 图标，点击OK进行绘制即可。

这样韦恩图就很快绘制好了，图中的圆括号中类似二进制的数字表示不同分组的包含关系，1表示包含，0表示不包含。

之后我们就可以根据自己的喜好对图形的外观进行调整啦~

02鼠小弟

鼠小弟是“科研日精进”生信团队研发推出的一个永久免费、免注册，随点随用的生信平台，绘制韦恩图也不在话下。

网站地址：

https://cloud.keyandaydayup.com/

进入网站后，选择“绘图工具”，在下方的图标类型中找到“韦恩图”，点击“使用”；

准备好数据后，点击“Browse”来从本地导入数据，可以识别三种类别的数据：由制表符分隔的txt文档，由逗号分隔的csv文件，和Excel表格的两种常见格式xls或xlsx，也就是说支持txt、csv、xls、xlsx这四种文件格式，上传的数据需要是这几种格式中的一种。

在“颜色”选项下可自行依次设置各组区域的颜色，点击色块即可更改，也可手动输入需要的颜色代码更改。

我们在前面的推文“学习顶刊配色，这几个SCI绘图配色网站一定要收藏好”中，为大家推荐了多个配色工具，有需要的小伙伴可以查看！

组名和数字的字体大小也可根据需要进行修改，也可设置“完成后发送结果到邮箱”；

提交后，鼠小弟会给出一段任务编号，这段任务编号可在右侧下载结果。如果数据较大分析时间较长，可以等一段时间再来下载。

对绘制好的韦恩图，有多种格式结果可供下载，如.png、.pdf、.svg，选择自己需要的格式下载即可。

03TUTU网站

TUTU网站也是一个可在线绘图的网络服务器，网站地址如下：http://www.cloudtutu.com/

进入网站后，网页会自动出现账号与密码，输入验证码，登录即可，点击“工具”，找到“维恩图”；

在“帮助文档”中有非常详细的使用说明书，大家可以自行参考，这里就不再赘述了。

值得一提的是，前面我们介绍的韦恩图绘制只可用于五组及五组以下数据的绘图，如果数据更多，可以绘制花瓣图和UpSet图，这三种图形TUTU网站均可绘制。

样品个数少于5个推荐使用venn图；样品个数大于等于6个，推荐使用花瓣图，只能显示共有和特有的元素个数；

UpSet图可以很好地展示多个集合之间的共有或特有元素。绘制这些图形时，只需在“绘图类型”中进行选择即可。

这里我们重点说一下UpSet图，UpSet图主要可分为三个部分：

1. 左侧柱状图展示各原始数据集中包含的元素总量；如下图中的Symbol 1~8；

2. 右下方交集点的部分，通过横向的对应关系，用点指代左侧的对应数据集名称。通过纵向实现点与点之间的连接，来表示对应数据集之间存在交集的情况。即通过点与点之间的连接，对应传统韦恩图中圈与圈的重叠。比如第二列代表Symbol 2~8分组共有但是Symbol 1组没有；

3. 上部分为各个分组独有和共有的数量，通过纵向的对应关系，表示该交集情况下的交集元素数量。如下图中第一个柱子代表Symbol 1~8分组共有的数量为36；第二个柱子代表Symbol 2~8分组共有但是Symbol 1组没有的数量为28。

以上就是本期利刃君为大家分享的多种绘制韦恩图的方法，这些方法都可以免费使用，当然熟悉R语言的小伙伴，使用R语言进行绘制可以有更多的可能性。此外，我们在前面的推文“有了这款高效生信分析绘图神器，还学什么R语言”中，为大家介绍了生信分析绘图工具——仙桃学术，也可完成韦恩图和UpSet图的绘制，感兴趣的小伙伴也可以自行尝试~