对于支原体感染，以前通常情况都是推荐首选阿奇霉素。除了阿奇霉素，四环素类药物（四环素、多西环素、米诺环素）、氟喹诺酮类抗菌药物（左氧氟沙星、莫西沙星等）以及克拉霉素等也都对支原体有抑制杀灭作用。
简单说一下支原体，它是一种比细菌还小的原核微生物，没有细胞壁，细胞中唯一存在的细胞器是核糖体。由于没有细胞壁，所以β内酰胺类抗菌药物如青霉素、头孢类对它是不起作用的，因为β内酰胺类抗菌药物主要是通过抑制细菌细胞壁的合成来杀灭细菌。
支原体引起的肺炎是社区获得性肺炎的常见病原体，过去医师如果考虑患者是支原体肺炎，一般就是首选大环内酯类抗菌药物阿奇霉素、红霉素等。
但是现在由于阿奇霉素已经使用比较久，使用过于普遍，支原体对其逐渐产生了耐药。研究显示，在东亚地区支原体对阿奇霉素的耐药率可能高达60%以上，中国的耐药率更高。
所以一些指南如《中国成人社区获得性肺炎诊断和治疗指南》把阿奇霉素列为了次选药物，首选药物为左氧氟沙星、莫西沙星、多西环素、米诺环素等。
由于轻症的支原体感染有自限性，所以使用某些抗感染药物好转，这可能并不是药物起效，而是疾病自愈。对于一些重症支原体感染，也可能不是药物耐药，而是由于混合感染，所以临床上是否选用阿奇霉素，还应该综合考虑。对于儿童支原体感染，应该还是首选大环内酯类药物。
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