在《名侦探柯南》的故事中，黑衣组织是贯穿全篇的剧情主线，组织前期一登场就给人巨大的压力，他们仿佛就成为了黑暗的化身，一登场就带来了危险，然而随着剧情的不断推进，我们可以发现黑衣组织并没有一个真正让人闻风丧胆的存在，假如用红黑对立的角度来看，也就是少了一个纯黑的反派，这就使得组织的恐怖程度大大下降。
在黑衣组织中率先登场的就是琴酒和伏特加，伏特加这个人物并非是大奸大恶之徒，他在第一集登场的时候他和一公司经理进行走私枪支底片交易，黑衣组织是有这个公司经理犯罪的把柄的，组织只是敲诈了他一笔，就如伏特加所说的他本可以要了对方的命的，但是伏特加就是老老实实的完成了交易，而且居然还劝对方不要再犯罪了……
伏特加表现的根本就不是大奸大恶的样子，反而就是一副琴酒小弟的既视感。
琴酒相比于伏特加绝对算是一大反派了，但是琴酒也做不到一黑到底，虽然琴酒平日里冷酷残忍，头脑冷静，眼神冷厉，似乎可以毫不犹豫地杀死任何人，但是假如细数琴酒杀过的人的话居然会发现大部分都是组织内的成员！
目前他杀死过的人就有宫野明美、皮斯克、爱尔兰，现在他一直追杀的人也是组织中的宫野志保，身为一个反派他做的事情却是不断杀死组织内的人，这些组织内的成员本来给人的好感就不大，除了明美之外，他杀死的其他组织内的人还给人一种给柯南助攻的既视感，琴酒假如真的要成为一个邪恶的反派的话就需要对真正的红方成员下手，这样才能成为一个纯黑的反派，现在的琴酒因为四面都是卧底反而成为了一个可怜的人。
除了伏特加和琴酒之外黑衣组织再难找出一个做过坏事比较多的人了，要做到纯黑更是难上加难。
黑衣组织目前的刻画就是雷声大雨点小，虽然总是给人一种他们作恶多端的感觉，但是他们真正做过的让人咬牙切齿的坏事并不多，甚至要找一个纯黑的角色都很难。
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