明日方舟更新了新活动生于黑夜的关卡以及剧情，这次的剧情以赫德雷、伊内丝和W作为主人公贯穿整个故事，主要是讲了W加入整合运动之前和刚加入整合运动的故事。故事非常简单，用三句话概括就是：W加入赫德雷的佣兵团；W在罗德岛碰见特蕾西娅且特蕾西娅被杀害；W在赫德雷的劝说下加入整合运动。但是简单的剧情中却隐藏着大量的的线索，明日方舟剧情上的一个大坑被填上，一个埋藏了很久的秘密被解开。
这个隐藏内容就是，博士沉睡之谜。大家应该都清晰地记得，明日方舟刚开始第一个剧情，就是阿米娅唤醒沉睡的博士，也就是玩家本人，这样既给了玩家很强的代入感，又给博士这个角色蒙上了一层神秘的面纱。当时也有很多人猜测博士到底睡了多久，甚至有人推测是沉睡了500年！
但是这次活动，给出了这个答案，不仅说明了沉睡的时间，还讲出了沉睡的原因。虽然没有直说，但却隐藏在字里行间。首先沉睡的原因，这个原因还是比较明显的，剧情里W追杀一个萨卡斯战士的时候，萨卡斯说进行了一场针对特蕾西娅的“斩首行动”，而在这次行动后，博士就消失了。
而在明日方舟首次登陆的开场动画中，博士回忆起自己在手术台上抢救。由这两点进行推断，博士就是在这次斩首行动中受到了波及，不得不陷入沉睡。
至于沉睡的时间，就比较复杂了，故事线中的时间非常混乱且没有固定的时间轴作为参考，但还是有一些蛛丝马迹。首先是伊内丝这一句：“和三年前给我的感觉一样。但他……”这个但他中的“他”，指的就是博士本人，也就是说，从伊内丝和赫德雷离开罗德岛到现在他们在切尔诺伯格打仗，这之间间隔了三年。
我们知道，游戏的第一章就是在切尔诺伯格唤醒博士且逃离切尔诺伯格，那么这一切就都对上了。还有一个与之相辅相成的证据，那就是干员资料中阿米娅的战斗经验。
没错，就是三年。在新活动的剧情中，W刚被从战场上救起，在罗德岛苏醒后，碰到的第一个陌生人，就是幼年的阿米娅。很明显，当时的阿米娅还是一个孩子，罗德岛当时还有特蕾西娅作为首领，所以阿米娅应该是被保护起来的孩子，她应该并没有参加过战斗，也就没有战斗经验。
但是我们也知道，阿米娅有很强的原石技艺，由此可以推测出，在斩首行动中，阿米娅为了保护特蕾西娅而使用原石技艺进行战斗，这也就是她战斗经验的开始。所以三年的战斗经验，刚好对上了伊内丝所说的“三年之前”。综上所述，博士沉睡之谜就是在斩首行动中受伤，然后不得已沉睡了三年，最后被阿米娅唤醒。
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