肝囊肿是一种良性的病变，通常没有症状，多在体检时无意被发现。
通俗地说，肝囊肿就是肝脏里面的某一段胆管扩张，然后入口和出口都被堵塞之后，分泌物增多、潴留演变而来的一个“软泡泡”，囊肿内一般没有胆汁。
肝囊肿，与周围组织之间有囊壁隔开，不相互交通的。
肝囊肿里面，充满着囊液，而并非实质性的人体组织，“没有肉在里面”，不是肿瘤性疾病。这种囊液，大多数情况下类似于凝胶或果冻状，颜色不定。
肝囊肿有很多原因，比如感染、结石、寄生虫、水肿、瘢痕等等，也有一些肝囊肿是先天性的。
比如多发囊肿的多囊肝，这种先天性的肝囊肿通常合多囊肾，和遗传因素有关系，是一种常染色体显性遗传病。
少部分肝囊肿，实质上是一种良性的囊腺瘤，也有极罕见发展为囊腺癌的。
肝囊肿绝大部分情况下没有肝脏实质细胞的参与，并不会导致甲胎蛋白（AFP）的升高；因为甲胎蛋白是由胎儿肝脏和新再生的肝细胞所合成的的，肝囊肿并不涉及到肝细胞再生，一般也不引发肝炎发作，也并非肝癌。
所以，很明显肝囊肿本身不会导致甲胎蛋白升高。
但是，任何一种疾病状态，总是有一些特殊情况存在。
当肝囊肿破裂出血，或因此而导致感染，波及到周围的肝组织细胞的时候，可能会导致周围肝细胞的坏死，这种情况下就会存在着新生的肝细胞增多的现象，就有可能导致甲胎蛋白的升高。
当然，肝囊腺瘤转变为肝囊腺癌时，如果癌症在肝内扩散，也可能会导致甲胎蛋白升高。
最后，对于那些有肝囊肿，同时也有甲胎蛋白升高的患者，建议要做进一步的检查，有可能原先认为的肝囊肿，其实可能就是肝癌或者其他的一些肿瘤性的疾病，最合适做的检查是增强磁共振（MRI）。
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