民航客机在空中飞行并不是无拘无束想往哪飞就往哪飞，要遵循几个原则。一是在航路上依照空管的指令飞行。空管分为区调，进近，塔台，分别按照距离机场的远近指挥民航客机飞行。航路也都是早就规划好的，在国际民航组织备案，飞机不能违背航空管制的指令，也不能偏离航路。大家都应该记得前一段大陆新开了一条航路，其实早就经过国际民航组织的备案和批准，但一样惹得某地呱呱乱叫的事件。而区域调度是分别接力了，从一个管制区到一个管制区，进近是快到机场时分配高度和航路以及降落次序，到机场塔台指挥起飞和着陆。这是外部对民航飞机的各种规则，民航飞机必须遵守。
二个原则是民航公司自己的选择，民航飞机能否在他国某个机场起降，是需要拿航权的，分为好几个级别。这个需要民航公司所在国家和公司自己依据政治、经济等各种因素考量和谈判。首先政治因素判断能不能飞，再有经济因素判断飞了赚不赚钱，才去进行各种谈判。谈好可以飞了，就要规划航路，本着安全、经济、快速的原则选择航线。
可见，民航飞机的飞行轨迹是受严格控制的，如果出现明显的偏离，是一定会被发现和被采取措施的。如果未经允许进入他国，会马上被这个国家的空军力量拦截。标准的拦截程序一般是先由地面空管或空军进行无线电呼叫，取得联系后纠正其错误。这时一般也会有战斗机升空伴飞已被不测，特别是911之后，对于入侵飞机一般都是第一时间进行战斗拦截。如果地面和空中都无法和入侵飞机取得联系，战斗机只能通过飞行动作进行拦截，要是再不理会就有可能开火警告，警告无效后经高层批准可以予以击落。毕竟击落一架民航机要担负的责任太大，除非一些鲁莽国家或鲁莽飞行员，谁也不会第一时间就将其击落。
当然，上面说的都是对空监视警戒比较完善的国家。一些落后国家或是莫名其妙国家的空域就非常“开放”了。2014年一架由埃塞俄比亚首都亚的斯亚贝巴飞往罗马的波音767客机遭劫持，该飞机最后在瑞士日内瓦降落。在这架客机被劫持后，途径的意大利空军和法国空军都先后派战机对其进行护航，但是闯入瑞士领空时，瑞士的战机却因为“下班了”并没有按惯例起飞护航。传为笑柄。
其实，别说是偏离航路的民航机了，正常飞行的民航客机，要是与地面通讯不正常，长时间不理睬地面呼叫或指令，也会有战斗机去“照看”一下的。
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