五子棋起源于中国古代，相传是在尧舜时期，距今已有四千多年的历史了。五子棋的发明与围棋有着千丝万缕的联系，五子棋与围棋同称为黑白传统棋种。
众所周知，黑白棋种的发明是要有一定的数学、天文学、哲学、军事学的发展为基础的。五子棋的行棋离不开数学的计算，而棋具本身也渗透着天文学和哲学的深奥。中国人自古以来喜欢用宇宙自然法则去解释日常事物，五子棋棋盘的横纵线及星位的标示，代表人们想象中宇宙天体的星辰分布之序。
五子棋棋子为黑白两色，代表着阴阳两性。尧舜时期是原始社会末期，是中国社会更新换代时期，当时的数学、天文学、哲学、军事学都有了很大发展。就尧舜时期的社会生活状况、物质条件和科学发展程度综合分析，发明五子棋的可能性很大。五子棋的发明是古代人们长期实践活动后，集聚众人智慧的结晶。
据史料文献介绍，五子棋大约在我国南北朝时期，传入高丽(朝鲜)、日本等国。在传入日本后，日本给予了五子棋很高的地位，对其不断进行了改良，赋予其一些更新的内容。日本于明治时期，经公开征名，把五子棋定名为“连珠”。把棋盘道数从当时延用围棋的横纵线各19条，改为横纵线各15条的五子棋专用棋盘。从规则上，逐步设立了先走方——黑方的“三三”、“长连”、“四四”禁手，而白方无限制的规定。禁手规则的出台，堵住了黑方几条获胜可能性的渠道，并给白方开辟了一条新的获胜渠道，就是强迫黑方走出禁手而被判负的“追下取胜”。日本又先后试行了“三手可交换”、“黑方指定开局”和“五手两打法”等规则条款，并向国际上进行推广。这些规则的实施进一步限制了黑方必胜开局的出现，并强迫黑方开局走不出最强点，使规则在平衡先后手子力方面前进一大步。
经过一系列的改良，原本黑白大大失衡的五子棋游戏，更复杂化、规范化，取胜的技巧性远远超过了使用黑白棋的机遇性，基本达到了竞技的要求并逐渐发展，成为今天我们所看到的五子棋运动。目前世界上已有很多国家和地区开展了五子棋运动，并已成为一项国际性智力运动。
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