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报告内容
地理适应和同源重组驱动谱系分化--以青春双歧杆菌为例
青春双歧杆菌是成人肠道重要的有益共生菌,其跨地域基因组分化及进化驱动力尚不清楚。本研究整合来自中国、美国等5 个国家395 株青春双歧杆菌基因组,其中中国和美国分离株分别为169 株和146 株,开展核心与泛基因组、系统发育、功能基因及同源重组分析。结果显示,该物种具有开放且高度可塑的泛基因组,并形成地理分层显著的两大谱系:中国分离株主要聚集于B进化支,美国分离株主要归入A进化支。两类菌株在碳水化合物利用和耐药基因携带方面呈区域特异性:中国菌株富集糖基转移酶,美国菌株富集碳水化合物结合模块和羧酸酯酶;基因组岛是区域特异功能基因和耐药基因获得的重要载体,提示饮食结构、抗生素暴露等选择压力可能塑造其功能适应。中国来源菌株的重组相对于突变的贡献高于美国来源菌株,且连锁不平衡衰减较快,表明同源重组是遗传多样性和谱系分化的重要驱动力。本研究揭示了地理选择压力与同源重组共同塑造青春双歧杆菌基因组和功能格局的机制,为理解菌株地域适应及精准筛选与应用提供理论依据。
专家介绍
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张文羿 教授
内蒙古农业大学食品科学与工程学院
张文羿,二级教授、博士研究生导师、国家“万人计划”科技创新领军人才,主要从事乳酸菌基础研究,致力于拓展其开发利用边界。近些年,在《Journal of Advanced Research》《Advanced Science》《Trends in Food Science & Technology》等期刊发表论文60 篇,主编学术专著1 部,参编学术专著两部;主持国家自然科学基金(重点、青B、面上)、国家重点研发计划子课题等科研项目;曾经获得国家科学技术进步二等奖、教育部技术发明一等奖、内蒙古自然科学二等奖、内蒙古青年科学技术创新奖等科技奖励;荣获SATOL生命科学创新创业领军人物、内蒙古突出贡献专家和内蒙古优秀科技工作者等荣誉称号;兼任期刊《Food Frontiers》和《Food Safety and Health》副主编。
实习编辑:宋秋枫;编辑:阎一鸣;责编:张睿梅
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