2026 年徐振江团队在 Microbiome 上发表的一项研究表明牙龈卟啉单胞菌通过其毒力因子牙龈蛋白酶诱发肠道菌群失调并增强 Th17 细胞介导的免疫反应,从而加剧肠道炎症[1]。同期,该团队另一项研究开发了能系统预测细菌转录终止与 3' stem-loop 结构的深度学习工具 BATTER,为在微生物群落层面解析转录调控提供了新的分析框架[2]。
同年,王帅等在 bioRxiv 预印本中开发了 MODIFI 工具[3],利用宏基因组长读长的动力学信号,在无需配对对照实验的条件下实现 DNA 修饰位点与甲基化基序的识别,进而完成菌株水平的宿主-元件关联推断,为在复杂群落中解析微生物表观遗传调控及宿主-元件互作提供了新的方法路径。
这些前沿发现共同揭示了一个核心问题:微生物如何通过分子层面的精密调控影响人体健康?为深入探讨这一话题,华大科技将于 2026 年 8 月 18 日(周二)10:00~12:00 举办「大咖面对面 | 微生物组前沿:算法创新与疾病机制双重突破」主题直播。特邀加州伯克利博士后王帅分享如何基于 PacBio HiFi 读长解析宏基因组 DNA 修饰图谱与宿主-元件关联;徐振江教授则将系统解读口腔微生物时空动态、下消化道疾病关联及非编码调控线索。现在报名参与直播,更有机会获得保温杯、蝾螈袋、洗漱包、文创礼包等精美礼品!
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直播亮点抢先看
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王帅(加州大学伯克利分校 博士后研究员)
课程主题
宏基因组菌株水平 DNA 修饰图谱解析
课程亮点
MODIFI 算法:宏基因组水平甲基化快速识别
基于甲基化特征的菌株级「宿主-元件」精准追溯
从测序数据到甲基化分析和宿主元件相互作用分析应用
未来拓展:甲基化对基因表达以及微生物适应、演化的调节
徐振江(教授 博士生导师)
课程主题
口腔微生物时空动态及其对下消化道疾病的影响
课程亮点
口腔微生物时空动态与群落失衡机制解析
口腔微生物异位定植与下消化道疾病关联
从「相关性」走向「分子机制」的研究新路径
微生物转录终止子预测与非编码调控注释
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内容策划:沈佳钰、刘青
内容审核:朱卿
题图来源:图虫创意
参考文献
[1] Li M, Cui J, Qu R, et al. Porphyromonas gingivalis induces intestinal inflammation through gingipain-dependent gut microbiome dysbiosis. Microbiome. 2026.
[2] Jin Y, Cui J, Liu R, et al. Conserved 3' stem-loop structures enable comprehensive analysis of bacterial transcription termination in metagenomes. Microbiome. 2026.
[3] Wang S, Guitor AK, Valentin-Alvarado LE, et al. Metagenomic strain-resolved DNA modification patterns link extrachromosomal genetic elements to host strains. bioRxiv. 2026
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