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信得科技检测团队在国际学术期刊《PLOS ONE》上发表鸭圆环病毒流行病学调查及遗传进化分析报告,为疫病精准防控和疫苗研发提供科学依据

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2025年5月,山东信得科技股份有限公司检测中心刘春国博士团队在国际学术期刊《PLOS ONE》上发表题为《2022年中国鸭圆环病毒流行病学调查及遗传进化分析》的研究论文。该研究系统揭示了我国鸭圆环病毒(DuCV)的流行态势、基因型分布及重组特征,为鸭圆环病毒的精准防控和疫苗研发提供了重要的科学依据。


一、研究背景

鸭圆环病毒(DuCV)是一种无囊膜的单链环状DNA病毒,属于圆环病毒科。感染鸭群后,DuCV可引起免疫抑制,导致生长迟缓、羽毛发育不良,并易继发其他细菌或病毒感染,给水禽养殖业造成严重经济损失。

目前DuCV主要分为DuCV-1、DuCV-2和新近发现的DuCV-3三种基因型,各基因型之间的交叉保护作用有限。我国虽是水禽养殖大国,但针对DuCV的系统性流行病学调查及全基因组遗传进化研究仍相对缺乏。为此,本研究立足于水禽产业实际需求,对2022年全国17个省份的2944份样品进行了全面检测,旨在明确DuCV的流行率、地域分布、共感染特征、基因型演化规律及重组事件,为防控策略的制定提供科学支撑。

二、分子检测及流行病学特征

总体阳性率:DuCV总体阳性率为20.8%(612/2944),但各省差异显著,范围在0%~54.8%之间。其中福建省阳性率最高(54.8%),其次为广西壮族自治区(30.4%),贵州省和浙江省未检出阳性。

时间与日龄分布:时间分布上未见明显季节规律。日龄分析显示,21~40日龄的雏鸭阳性率最高,占阳性样本总数的66.5%。此外,研究还检出1例鸭胚阳性(0.2%),以及最大阳性鸭日龄达530天。

共感染情况:在612份阳性样本中,有207份存在混合感染,占比33.8%。最常见的共感染病原为细小病毒(包括新型鹅细小病毒和番鸭细小病毒)和鸭疫里默氏杆菌。此外,还检测到鸭星状病毒、鸭肝炎病毒、鸭呼肠孤病毒、新型鸭呼肠孤病毒、禽流感病毒和禽腺病毒等。值得注意的是,临床上两种或多种病原(含细菌和病毒)混合感染现象十分普遍,实际共感染率可能高于本数据。


三、遗传进化分析

研究团队从山东、安徽、广东、广西、福建、江西、河南和四川8个省份的阳性样品中获得了51条DuCV全长基因组序列(GenBank登录号:OR387724~OR387774)。

系统发育分析表明:

2015年之前,我国存在多种DuCV基因型;

2021年以后,DuCV-1b和DuCV-2c成为主要流行基因型,其他基因型逐渐减少或消失;

DuCV-2c主要分布于南方省份,DuCV-1b在南北方省份均有检出;

DuCV-1c仅在广东省检出,且广东省存在多种基因型共流行。


基于全基因组的DuCV遗传进化树

内圈颜色代表不同基因型,外圈颜色代表不同年份,红点为本研究获得的序列,红五角星为我国不同年份检出的DuCV株

同源性分析显示:DuCV-1株间核苷酸序列一致性在93%~100%之间,DuCV-2株间的在97.5%~100%之间;无论在同一基因型内部还是不同基因型之间,ORF2的氨基酸序列一致性均低于ORF1。


四、氨基酸位点分析

对51株DuCV的ORF1、ORF2和ORF3进行蛋白质预测分析,发现:

与首次发现的参考株(AY228555.1)相比,所有分离株在复制相关蛋白中均发生L16I突变;

所有DuCV-2c的Cap蛋白均发生F23L和K64R替换,其中50%(7/14)还发生G18A突变。这些突变位于潜在的B细胞表位区域;


在DuCV-1b中观察到两组共变的氨基酸组合,分别形成两个不同的进化簇,部分氨基酸位点位于蛋白表面,可能影响病毒的糖基化或磷酸化。


三级结构预测显示,已报道的6个主要突变区大多位于蛋白表面,进一步提示这些位点可能影响病毒的抗原性和生物学功能。


Cap蛋白三级结构预测

(A)和(B)为5个可变区的位置;(C)显示了部分氨基酸的位置以及基因突变导致的蛋白质构象变化

五、重组分析

利用RDP4软件对51株DuCV及NCBI数据库中2023年前的全部DuCV全基因组序列(共317条)进行了重组分析。采用7种检测方法,Bonferroni校正P值设为0.05。

共检测到23个重组事件(至少3种方法支持)。其中,本研究中获得的LP0920-N2、FDD0930、C0720-Y7-2和ZCY0822被鉴定为主要的亲本株,分别来自安徽、四川、山东和广西,提示这4个地区的鸭群在DuCV进化中发挥了重要作用。重组事件发生在不同基因型之间或不同国家分离株之间。



六、主要结论

1.感染普遍,区域差异明显:2022年我国鸭群中DuCV感染较为普遍,总体阳性率为20.8%,福建和广西为高发区域,21~40日龄雏鸭是主要感染群体。

2.共感染常见,需综合防控:DuCV与细小病毒或鸭疫里默氏杆菌的混合感染非常常见,临床应重视多病原的综合防控。

3.基因型格局已转变:我国DuCV流行已从早期的多种基因型共存转变为以DuCV-1b和DuCV-2c为主导的流行格局,不同地区流行的基因型存在差异。

4.重组频繁,多个地区为亲本来源:安徽、四川、山东和广西等地的DuCV株系是重要的重组亲本来源,不同基因型间及不同国家来源的毒株间均发生了重组事件。

5.氨基酸变异可能影响病毒功能:Cap蛋白的氨基酸变异位点可能影响病毒的抗原性和生物学功能,值得进一步研究。

七、防控建议

说明:以下防控建议是本文作者根据文章揭示的流行情况所做的总结,供参考。

针对当前我国DuCV以DuCV-1b和DuCV-2c为主导、共感染频繁、重组活跃的复杂流行态势,结合水禽养殖实际,提出以下综合防控建议:

1.加强生物安全与饲养管理

实行全进全出制度,避免不同日龄、不同来源鸭群混养;

使用二氯异氰尿酸钠(1:200)定期消毒,尤其是育雏舍和孵化车间,减少环境中病毒载量;

严格控制鸭胚来源,避免垂直传播(本研究中已检出鸭胚阳性)。

2.重视免疫调节,合理使用转移因子

由于目前尚无商品化的DuCV疫苗,且DuCV感染主要导致免疫抑制,因此增强鸭群自身免疫功能是当前防控的关键补充手段。

转移因子作为一种小分子免疫调节剂,能够非特异性地增强T细胞功能,提高机体抗病毒和抗细菌感染能力。在DuCV高发区域或高发日龄(21~40日龄雏鸭),建议在饮水中添加禽用转移因子(信必妥),连续使用3~5天,可配合抗病毒中药或益生菌使用,有助于缓解DuCV引起的免疫抑制,降低细小病毒和鸭疫里默氏杆菌等病原的继发感染风险,提高其他疫苗免疫后的抗体水平(尤其在共感染状态下)。

使用提示:转移因子不能替代疫苗,但在无商品化疫苗的阶段,可作为重要的辅助防控工具。建议选择正规厂家生产的、经检测无外源病毒污染的转移因子产品。

3.精准监测与病原筛查

对种鸭群开展DuCV定期监测,淘汰持续阳性种鸭;

对发病鸭群进行多病原联合检测(DuCV + 细小病毒 + 鸭疫里默氏杆菌等),指导临床精准用药。

4.加快疫苗研发与区域化免疫策略制定

针对当前优势基因型(DuCV-1b、DuCV-2c)开展二价或嵌合疫苗研发;

在南方DuCV-2c高发区优先开展疫苗免疫试验,积累保护效力数据。

原文信息

Li P, Zhang F, Bao C, Liu H, Yu K, Zhu H, Wang X, Shen K, Yang T, Song Q, Li Z, Liu C. Epidemiological investigation and analysis of the genetic evolution of duck circovirus in China, 2022. PLOS ONE. 2025, 20(5): e0323282. doi: 10.1371/journal.pone.0323282.

本文作者:李培东

责任编辑:刘春国、王雪


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