近日,深圳医学科学院颜宁团队联合清华大学团队,在《科学》发表糖质结构研究重磅成果。据深圳医学科学院24日消息, 这项成果为复杂糖质高级结构的发现、鉴定与工程化利用提供了新的方法学框架,标志着糖质结构生物学正进入原子分辨率解析的新阶段。
4月24日,颜宁在个人微博转发了深圳医学科学院发文,并表示:“忍不住得瑟的一个工作——我们2024年发表第一个跟糖质相关的结构,过去两年通过CryoSeek发现大量糖质结构(都在# 收录),但一直不知道来自何方。这次通过对金藻微绒毛高达1.8埃分辨率的结构分析,不仅刷新了我们对糖质结构的理解,而且确立了一个很好的研究体系。祝贺我优秀的团队!”
4月26日,颜宁针对冷冻电镜技术的发展和一些“黑粉”言论作出回应。颜宁在个人微博中写道:“AlphaFold突破,无知者:‘颜宁的专业被取代了,混不下去回国了’【不是,这么说话的人有没有意识到自己心里是多崇洋媚外啊,合着潜意识就觉得出国才是升,只有混不下去才能回国,而不是因为更好的环境?都21世纪第三个十年了,某些人骨子里的那些自卑就别无知无畏地丢人现眼了】;专业人员:AI赋能,终于又能摆脱一部分重复劳动了,可惜AF还不太行,好多预测不出来或者预测不准。”
颜宁近期接受《人民日报》记者专访,聚焦其团队在糖质生物学领域的最新突破。
据人民日报客户端4月29日消息,颜宁近期接受《人民日报》记者专访,聚焦其团队在糖质生物学领域的最新突破。
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颜宁近照。图源:深圳医学科学院
报道提到,深圳医学科学院/深圳湾实验室/清华大学颜宁团队与合作者利用“酷寻”(CryoSeek)策略,逐步揭开了糖质这一“生命暗物质”的神秘面纱。
特别是,在《科学》杂志发表的最新成果中,颜宁团队获得了最高分辨率达到0.18纳米的天然糖质复合物超高分辨率三维结构,实现了在原子分辨率的“可视化”研究,打开了糖质生物学研究的“天眼”。
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冷冻电镜分析揭示金藻管状微绒毛表面存在的大量复杂糖质及其近原子分辨率三维结构。图源:深圳医学科学院
在采访中,颜宁指出,糖质虽与核酸、蛋白质、脂质并列为生命四大基本生物大分子,却长期研究滞后,“根本原因之一是糖质研究中存在一个巨大的瓶颈——科学家看不清它的内部结构。”
颜宁解释说,“在生命科学领域,结构决定功能。这里的‘结构’,既包括长宽高外形这些几何形式,也包括所用的材料等物理化学性质。就像家里面,不同的结构、材料决定了这个地方是厨房、那个地方是卫生间一样,生物大分子的结构不同,所具有的功能和作用也各不相同。”
“因为一直缺乏好的研究系统,所以过去即便用最强大的冷冻电子显微镜也很难‘看清’复杂糖质的内部构造。”颜宁说。
为此,颜宁团队另辟蹊径,创造性地提出酷寻(CryoSeek)研究策略——“结构先行”的生物发现新范式。“核心是把冷冻电镜这一传统的结构解析工具变为发现未知生物大分子的‘放大镜’”。
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CryoSeek数据平台首页。图源:深圳医学科学院
今年4月24日,发表在《科学》上的最新研究进展中,颜宁团队以年轻的博士生黄隽豪为主力、与清华大学闫创业团队合作,获得了整体糖质分辨率约0.2纳米(一根头发丝的40万分之一)、核心局部最高达0.18纳米的超高分辨率三维电镜密度图。
颜宁告诉记者:“在这项研究中,我们系统揭示了糖质在生物大分子高级组装中的结构性作用,为复杂糖质及其高级结构的发现、鉴定、计算化学、工程化利用提供了新的方法学框架,标志着糖质结构生物学正进入原子分辨率解析的新阶段。”
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在《科学》发表的论文截图。图源:深圳医学科学院
与此同时,由颜宁实验室博士后陈晟开发的AI自动建模工具EModelG,把糖质结构建模的效率从传统手动建模的几星期提升到自动建模的半小时,为天然糖质的大规模结构研究提供了方法学支撑,并降低了复杂的专业门槛,可以令不同学术背景的更多研究者有效参与进来。
值得一提的是,在该论文于国际期刊正式发表之前,颜宁团队提前几个月将成果公开发布在由深圳医学科学院联合深圳湾实验室、清华大学、西湖大学建设的 “浪淘沙”预印本平台(Langtaosha.org.cn),第一时间与国内外同行分享研究的核心发现、技术方法与原始数据,以加快推进相关研究。
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“浪淘沙”预印本平台网页。图源:深圳医学科学院
一花独放不是春,百花齐放春满园。颜宁表示,与核酸、蛋白质相比,糖质生物学的研究还是“万里长征第一步”,前面是更为广阔的星辰大海,需要国内外同行携手努力。
(来源:人民日报)
颜宁:说这话的人多崇洋媚外啊
近日,中国科学院院士、深圳医学科学院创始院长、深圳湾实验室主任颜宁针对冷冻电镜技术的发展和一些“黑粉”言论作出回应。
4月26日,颜宁院士通过个人微博发文:“娱乐博主潜水多了,经常看到一个说法‘粉黑都满意’——这个好像也特适用于我们学科耶。冷冻电镜技术横空出世(这真的是game changer),三位在该领域深耕半世纪的前辈得诺奖,无知者:‘看,他们只会利用电镜发论文灌水’;结构生物学研究人员则是喜大普奔,终于不用把宝贵的时间用在令人绝望的结晶这一步了,我们被赋能了,加速了理解生命、药物研发的进程。”
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颜宁在个人微博中写道:“AlphaFold突破,无知者:‘颜宁的专业被取代了,混不下去回国了’【不是,这么说话的人有没有意识到自己心里是多崇洋媚外啊,合着潜意识就觉得出国才是升,只有混不下去才能回国,而不是因为更好的环境?都21世纪第三个十年了,某些人骨子里的那些自卑就别无知无畏地丢人现眼了】;专业人员:AI赋能,终于又能摆脱一部分重复劳动了,可惜AF还不太行,好多预测不出来或者预测不准。”
颜宁介绍,“我们4月20日周一的Cell Chemical Biology是把之前早就放在预印本的荷塘月色鉴定出来的若干糖纤维正式发表,这不仅仅是报道结构,更是把自然界生物世界不为人知的一隅呈现出来,换言之,是发现了此前生物世界完全不知道的物质,直观看到了这些,特别是完全没有蛋白的纯糖纤维,毫无基因组序列可以参考,既激动人心,研究起来又困难重重。下一步就是三连问:它们是什么?它们做什么?它们从哪里来?(生物本质、生物功能、生物合成通路),这就是我们实验室正在吭哧吭哧做的。所以我们才说cryoseek 酷寻是一个结构优先的发现策略。而紧接着上线的Science论文(投稿前全文可在浪淘沙预印本平台免费开放获取)则是确立了一个研究体系,可以就其中我们命名为TLP-4的一类糖纤维展开系统研究了。高达0.2纳米分辨率的结构令我们精确地看到每一种糖,每一个结合的水分子,每一个金属离子——这在此前难以想象。而这个金藻株系连基因组序列都还没有,所以我们要先测序,才能开展后续很多实验。即便如此,多糖的序列并不能从基因组推测出来,AlphaFold连序列都没有,怎么预测啊?就算有序列,之前没结构,它也没法被训练啊。”
颜宁最后写道:我们现在要做的就是尽可能从一切重复劳动中进一步被解放,这是另外一个故事,现在要开会去了,晚上有空接着写。
稍早前,4月23日,颜宁团队联合清华大学团队在《科学》发表重磅成果。这项成果为复杂糖质高级结构的发现、鉴定与工程化利用提供了新的方法学框架,标志着糖质结构生物学正进入原子分辨率解析的新阶段。该研究核心成果早在2026年1月28日就已通过浪淘沙预印本平台面向全球首发,第一时间公开了研究的核心发现、技术方法与原始数据,比正式期刊发表时间提前了近3个月。
基础生物学家颜宁主要从事膜蛋白结构生物学研究,1977年11月生于山东省济南市,2000年于清华大学获学士学位,2004年于美国普林斯顿大学获博士学位,分别于2019年及2023年当选为美国国家科学院外籍院士及中国科学院院士。
颜宁在科学研究方面有开拓性的贡献,她的实验室率先成功阐明几种关键膜蛋白原子结构,为药物研发提供了重要启示,其研究成果发表于《自然》《科学》《细胞》等世界顶尖学术期刊,更曾两度被《科学》期刊评选为十大科学突破之一,其研究的影响延伸到医学的实际应用,尤其在理解疾病机理和开发新的治疗方法方面。
颜宁近年返回中国内地建立和领导深圳医学科学院,致力推动祖国的生命科学研究和教育。她的为人哲学是“作为女科学家可能充满挑战性,但并不至于阻止任何人前行;因此,勇往直前,做好自己本分”,激励年轻科研人员,成为女性典范。她于2024年获欧莱雅-联合国教科文组织世界杰出女科学家奖,进一步突显她作为全球科学研究领导者的地位。
(来源:澎湃新闻)
颜宁团队发布重磅成果!颜宁:忍不住嘚瑟
据深圳特区报25日报道,近日,深圳医学科学院颜宁团队联合清华大学团队,在《科学》发表糖质结构研究重磅成果。据深圳医学科学院24日消息, 这项成果为复杂糖质高级结构的发现、鉴定与工程化利用提供了新的方法学框架,标志着糖质结构生物学正进入原子分辨率解析的新阶段。
4月24日,颜宁在个人微博转发了深圳医学科学院发文,并表示:“忍不住得瑟的一个工作——我们2024年发表第一个跟糖质相关的结构,过去两年通过CryoSeek发现大量糖质结构(都在# 收录),但一直不知道来自何方。这次通过对金藻微绒毛高达1.8埃分辨率的结构分析,不仅刷新了我们对糖质结构的理解,而且确立了一个很好的研究体系。祝贺我优秀的团队!”
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据深圳特区报报道,颜宁团队搭建高分辨率冷冻电镜、糖蛋白质组学与AI建模融合研究体系,获得约2Å整体分辨率、核心局部1.8Å的超高分辨率三维电镜密度图,将天然糖质复合物研究推进至近原子分辨率层面。
糖质是生命四大基本生物大分子之一,在细胞识别、信号转导、免疫调控和结构支持等多种生理过程中发挥关键作用。此次研究结果的分辨率水平使对天然糖质的直接可视化成为可能,不仅支持多种单糖类型的精确识别,也为乙酰化、甲基化和硫酸化等多种共价修饰的判定提供了明确的结构依据。
在此基础上,研究者还通过整合结构生物学研究与靶向质谱技术,发现了一类基于“AND”基序的新型非经典N-糖基化类型,并借助结构聚类搜索揭示了该基序在多种高致病性物种中的进化保守性。
与此同时,由颜宁实验室开发的AI自动建模工具EModelG显著提升了糖质结构自动建模的效率,推动糖质结构解析从依赖间接片段信息推断向高精度直接建模转变,也为复杂天然糖质的大规模结构研究提供了方法学支撑。
据深圳医学科学院24日消息,颜宁团队的该项研究核心成果早在2026年1月28日就已通过浪淘沙预印本平台面向全球首发,第一时间公开了研究的核心发现、技术方法与原始数据,比正式期刊发表时间提前了近3个月。相关内容很快被Google Scholar、ResearchGate等主流学术平台收录,为相关研究提供了重要参考、避免了重复研究,充分展现了预印本模式在加速学术传播、推动开放科学发展中的核心价值。
另据报道,南方科技大学薛其坤-陈卓昱团队联合多单位,在无限层镍氧化物超导体研究领域取得重要突破。近日,成果发表在国际顶尖学术期刊《自然》。值得一提的是,这也是薛其坤-陈卓昱团队继4月8日在《自然》发表关于镍基氧化物薄膜超晶格的超导电性与电子结构的文章之后,半个月内发表的第2篇国际顶刊论文。
两项成果分别在量子材料、生命科学领域实现原创性突破,是深圳基础研究持续深耕结下的又一硕果,为相关领域科学研究与产业应用提供了策源动力。
(内容来源:深圳特区报、深圳医学科学院、@颜宁、南方都市报)
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