一文理清
多种构型异构概念
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在我们日常学习和阅读文献时,常常会遇到诸如 R/S、cis/trans、E/Z、syn/anti、endo/exo 等一系列构型术语。这些术语容易在概念上产生混淆。今天我们就简单的梳理一下。
在梳理各类立体构型术语之前,我们先弄明白相对构型与绝对构型这两个底层概念。
相对构型与绝对构型
01
绝对构型(Absolute Configuration)指手性中心上原子 / 基团的真实、唯一的空间排布,它不随参考物而改变。它是根据手性碳原子上四个不同的原子或基团在“顺序规则”中的先后次序来确定的,常使用 R/S 标记系统来命名,如图1。
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图 1
相对构型(Relative Configuration)是相对于参照物的空间关系,不代表绝对真实排布,常用 D/L、cis/trans等标记。例如糖类、氨基酸等天然手性化合物,通常以甘油醛为参照基准,以此判定其 D/L 相对构型,如图2。
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图 2
不同类型的构型标记法
02
2.1 R/S构型 (绝对构型)
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R/S 构型标记法(Cahn–Ingold–Prelog,CIP 规则) 是给手性中心(最常见为连 4 个不同基团的碳) 标记绝对构型的一套通用规则,R/S构型标记法是用于标记手性中心(通常是手性碳原子)绝对构型的国际通用标准。它是以 Cahn-Ingold-Prelog(CIP)顺序规则为核心判定依据。具体判断方法如下:
首先,按照所连原子(元素)的原子序数排列,原子序数大的序号小(优先)。对于所连原子的原子序数相同的情况,我们继续比较所连原子的所连原子的原子序数。
接下来,重新排列分子结构,让最小的(次序最低的)基团远离我们。观察由1到2再到3的旋转方向,如果是顺时针的,那么在手性中心上标注R;如果是逆时针的,则标注S。(书写字母 R 时,起笔为顺时针方向;书写字母 S 时,起笔为逆时针方向。可借助这一书写特征,快速判断 R、S 构型。)
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图 3
2.2 E/Z构型
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E/Z构型用来标记含双键结构的绝对立体构型。
国际统一规定:按“顺序规则”分别比较每个碳原子上连接的两个原子或基团,若两个较优基团在π键平面同侧为Z型异构体,在异侧者为E型异构体。Z和E分别取自德语单词“Zusammen”和“Entgegen”的首位字母,前者意思是“在一起”,后者的意思是“相反,相对”。
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图 4
2.3 cis/trans构型
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顺反(cis/trans)构型属于相对构型,仅表达相对空间关系,主要用于描述环状化合物、烯烃等不饱和结构中取代基的空间相对位置关系。
其中cis表示顺式:分子中两个特定基团位于环平面 / 双键同侧;trans表示反式:两个特定基团位于环平面 / 双键异侧。
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图 5
2.4 endo/exo(内/外)构型
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endo/exo(内/外)属于相对构型,用来标记双环桥环化合物,是桥环特有的立体构型命名,不用于普通烯烃、开链化合物。
判断方法:若取代基在反应中指向分子平面的外侧,或与双烯体的双键方向相反,则为exo构型。若取代基在反应中指向分子平面的内侧,或与双烯体的双键方向相同,则为endo构型。
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图 6
2.5 syn/anti
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syn/anti构型标记法属于相对构型,很容易与cis/trans构型标记法弄混,但二者有本质区别的:正如前文提到的,cis/trans多用来描述分子本身的静态立体构型(如环上取代基顺反);syn/anti主要用于描述反应过程的立体变化与加成方式,是一个动态的过程。比如顺式加成 syn-addition、反式加成 anti-addition、消除反应的 syn/anti 消除等。
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公众号丨有机合成知识积累
参考文献:
1.《基础有机化学》邢其毅等
2.《Organic Chemsitry》clayden等.
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