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Protein & Cell|左二伟/吴军团队建立可编程染色体替换平台——首次实现跨物种整条染色体替换

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染色体替换模型(chromosome substitution strains,CSS)是解析复杂性状与染色体功能的重要工具1,2,但传统方法依赖多代回交,周期漫长且几乎局限于同种系统。更具挑战性的问题是: 染色体是否可以跨物种稳定替换,并维持正常细胞与个体功能?

2026 年 3 月 9 日, 中国农业科学院深圳农业基因组研究所 左二伟 团队 与美国德克萨斯大学西南医学中心 吴军 团队合作 在 Protein & Cell 发表了文章

A Programmable Platform Enabling Targeted Chromosome Substitution and Cross-Species Stability Profiling
, 开发了 一套新的 特异性 染色体替换平台(TEAM, Targeted chromosome Elimination And Microcell-mediated chromosome transfer) ,首次在小鼠中实现了Y染色体的精准替换,并系统比较了小鼠Y染色体与人类Y染色体在小鼠体内的稳定性差异该项研究成果发表于 TEAM平台整合了两项关键技术:首先利用CRISPR/Cas9实现内源 Y 染色体 特异性 清除;随后通过微细胞介导染色体转移MMCT),将供体来源的完整Y染色体导入受体胚胎干细胞。该策略避免了传统CSS对多代育种和重组筛选的依赖,实现了染色体尺度的可编程替换(图1)



作为概念验证,研究人员首先将一条来自DBA/2品系的小鼠Y染色体替换进C57BL/6背景胚胎干细胞中。替换后的细胞保持正常核型和多能性,并成功通过四倍体补偿发育为健康成年雄鼠。尽管MMCT过程中存在一定DNA损伤和片段缺失,但替换后的鼠Y染色体在体内长期稳定,提示TEAM平台在同种染色体替换中具有良好兼容性与发育安全性。

随后,研究团队将人类胚胎干细胞来源的Y染色体转移至小鼠Y缺失胚胎干细胞中。结果显示,人类Y染色体能够在体外被成功转移并短期维持,且其多个基因在小鼠细胞中可被正常转录。然而,与小鼠Y染色体形成鲜明对比的是,人类Y染色体在细胞传代过程中快速丢失,在体内则表现为明显的组织嵌合性、结构重排与进行性损伤。

为解析人类Y染色体在小鼠中的失稳机制,研究团队系统分析了其着丝粒结构与蛋白组装状态。结果发现,人类Y染色体在小鼠细胞中表现出显著降低的CENP-A加载水平,部分染色体甚至完全缺失CENP-A信号,并伴随频繁的分离错误、微核形成与染色体重排。相比之下,内源小鼠Y染色体维持稳定的着丝粒结构和分离行为。这一现象提示着丝粒不兼容性是跨物种染色体替换的核心限制因素。


图 1 . TEAM平台实现染色体替换

本 研究建立了TEAM这一可扩展的染色体替换平台,实现了首次跨物种整条染色体替换实验,并系统揭示了人类Y染色体在小鼠体内失稳的分子机制。结果表明,染色体工程的关键挑战不只是“是否能够转移”,而在于“是否能够被宿主细胞系统稳定识别与维持”。 着丝粒兼容性由此成为跨物种染色体工程、人工染色体设计与合成基因组研究中不可回避的核心生物学约束。

值得注意的是,近期发表 于 Science 的研究同样报道了人类染色体在不同细胞系统中的转移与操控,为染色体工程提供了新的技术框架3。两项研究在研究目标和技术路线方面既有联系,也各具特色。在技术层面,该

Science
研究的优势在于:研究者利用外源合成DNA对人类染色体特定区域进行精准替换,实现了对整条染色体的高精度工程化操作。同时,该研究还在人类细胞与小鼠细胞中系统分析了染色体端粒长度变化,揭示了不同细胞环境对端粒维持的影响。


与之相辅相成 ,本研究 则进一步从染色体稳定性机制的角度展开,系统 比较同种与异种染色体替换后的表现, 揭示 了跨物种染色体在宿主细胞中逐渐失稳的重要原因。 除此以外 ,本研究不仅在体外细胞系统中开展实验,还在小鼠体内( in vivo )系统评估了染色体替换后的稳定性及潜在表型影响,从而提供了跨层级的功能验证。

因此,如果说

Science
的研究展示了如何精准操控染色体,那么本研究则进一步回答了另一个关键问题: 为什么某些染色体在跨物种环境中难以被稳定维持。 这两项研究从技术创新与生物学机制两个不同维度,共同推动了染色体工程与跨物种基因组研究的发展。

中国农业科学院 深圳 农业基因组所左二伟研究员和 美国德克萨斯大学西南医学中心吴军教授 为 论文 共同通讯作者,中国农业科学院 深圳 农业基因组所 博士后石磊 、 博士研究生杨霞丽 、 博士研究生吴明第 、 硕士研究生赵成业 为 论文 共同第一作者。

https://doi.org/10.1093/procel/pwag010

制版人: 十一

参考文献

1 Nadeau, J. H., Singer, J. B., Matin, A. & Lander, E. S. Analysing complex genetic traits with chromosome substitution strains.Nature Genetics24, 221-225, doi:10.1038/73427 (2000).

2 Wijnen, C. L. et al. A complete chromosome substitution mapping panel reveals genome-wide epistasis in Arabidopsis.Heredity133, 198-205, doi:10.1038/s41437-024-00705-1 (2024).

3 Petris, G. et al. High-fidelity human chromosome transfer and elimination.Science390, 1038-1043, doi:10.1126/science.adv9797 (2025).

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